Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPTX1Q15818 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPTX1Q15818 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPTX1Q15818 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPTX1Q15818 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPTX1Q15818 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPTX1Q15818 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPTX1Q15818 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPTX1Q15818 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPTX1Q15818 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPTX1Q15818 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPTX1Q15818 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPTX1Q15818 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NPTX1Q15818 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPTX1Q15818 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPTX1Q15818 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPTX1Q15818 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPTX1Q15818 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPTX1Q15818 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NPTX1Q15818 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPTX1Q15818 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPTX1Q15818 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPTX1Q15818 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPTX1Q15818 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPTX1Q15818 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPTX1Q15818 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPTX1Q15818 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NPTX1Q15818 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPTX1Q15818 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPTX1Q15818 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPTX1Q15818 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPTX1Q15818 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPTX1Q15818 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPTX1Q15818 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPTX1Q15818 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPTX1Q15818 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPTX1Q15818 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPTX1Q15818 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPTX1Q15818 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPTX1Q15818 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPTX1Q15818 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPTX1Q15818 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NPTX1Q15818 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NPTX1Q15818 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPTX1Q15818 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPTX1Q15818 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPTX1Q15818 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPTX1Q15818 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPTX1Q15818 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPTX1Q15818 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPTX1Q15818 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPTX1Q15818 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NPTX1Q15818 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NPTX1Q15818 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NPTX1Q15818 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPTX1Q15818 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPTX1Q15818 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPTX1Q15818 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPTX1Q15818 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPTX1Q15818 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPTX1Q15818 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPTX1Q15818 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPTX1Q15818 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPTX1Q15818 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPTX1Q15818 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPTX1Q15818 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPTX1Q15818 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPTX1Q15818 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPTX1Q15818 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPTX1Q15818 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPTX1Q15818 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPTX1Q15818 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPTX1Q15818 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NPTX1Q15818 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPTX1Q15818 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPTX1Q15818 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPTX1Q15818 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPTX1Q15818 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPTX1Q15818 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPTX1Q15818 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPTX1Q15818 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPTX1Q15818 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPTX1Q15818 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPTX1Q15818 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPTX1Q15818 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPTX1Q15818 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPTX1Q15818 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPTX1Q15818 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPTX1Q15818 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPTX1Q15818 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPTX1Q15818 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPTX1Q15818 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NPTX1Q15818 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NPTX1Q15818 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPTX1Q15818 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPTX1Q15818 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPTX1Q15818 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPTX1Q15818 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPTX1Q15818 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPTX1Q15818 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.5 ms