Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFNB3Q15768 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFNB3Q15768 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFNB3Q15768 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFNB3Q15768 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFNB3Q15768 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNB3Q15768 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNB3Q15768 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNB3Q15768 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNB3Q15768 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFNB3Q15768 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFNB3Q15768 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFNB3Q15768 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFNB3Q15768 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFNB3Q15768 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFNB3Q15768 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFNB3Q15768 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFNB3Q15768 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFNB3Q15768 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFNB3Q15768 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFNB3Q15768 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFNB3Q15768 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EFNB3Q15768 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFNB3Q15768 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFNB3Q15768 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFNB3Q15768 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFNB3Q15768 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFNB3Q15768 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFNB3Q15768 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EFNB3Q15768 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFNB3Q15768 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFNB3Q15768 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFNB3Q15768 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFNB3Q15768 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFNB3Q15768 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFNB3Q15768 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFNB3Q15768 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFNB3Q15768 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFNB3Q15768 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFNB3Q15768 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFNB3Q15768 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFNB3Q15768 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFNB3Q15768 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFNB3Q15768 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFNB3Q15768 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFNB3Q15768 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFNB3Q15768 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFNB3Q15768 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFNB3Q15768 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFNB3Q15768 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFNB3Q15768 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNB3Q15768 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNB3Q15768 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNB3Q15768 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNB3Q15768 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNB3Q15768 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNB3Q15768 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNB3Q15768 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNB3Q15768 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNB3Q15768 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNB3Q15768 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNB3Q15768 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNB3Q15768 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNB3Q15768 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNB3Q15768 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNB3Q15768 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFNB3Q15768 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFNB3Q15768 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EFNB3Q15768 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EFNB3Q15768 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFNB3Q15768 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFNB3Q15768 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFNB3Q15768 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFNB3Q15768 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFNB3Q15768 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNB3Q15768 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNB3Q15768 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNB3Q15768 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNB3Q15768 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNB3Q15768 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFNB3Q15768 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EFNB3Q15768 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFNB3Q15768 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFNB3Q15768 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFNB3Q15768 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFNB3Q15768 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFNB3Q15768 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFNB3Q15768 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFNB3Q15768 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EFNB3Q15768 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFNB3Q15768 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFNB3Q15768 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFNB3Q15768 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFNB3Q15768 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFNB3Q15768 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFNB3Q15768 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFNB3Q15768 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFNB3Q15768 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EFNB3Q15768 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EFNB3Q15768 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms