Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYTH1Q15438 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYTH1Q15438 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYTH1Q15438 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYTH1Q15438 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYTH1Q15438 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYTH1Q15438 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYTH1Q15438 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYTH1Q15438 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYTH1Q15438 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYTH1Q15438 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYTH1Q15438 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYTH1Q15438 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYTH1Q15438 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYTH1Q15438 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYTH1Q15438 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYTH1Q15438 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYTH1Q15438 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYTH1Q15438 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYTH1Q15438 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYTH1Q15438 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYTH1Q15438 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CYTH1Q15438 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYTH1Q15438 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYTH1Q15438 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYTH1Q15438 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYTH1Q15438 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CYTH1Q15438 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYTH1Q15438 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYTH1Q15438 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CYTH1Q15438 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYTH1Q15438 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYTH1Q15438 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CYTH1Q15438 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYTH1Q15438 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYTH1Q15438 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYTH1Q15438 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYTH1Q15438 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYTH1Q15438 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYTH1Q15438 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYTH1Q15438 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYTH1Q15438 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CYTH1Q15438 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYTH1Q15438 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYTH1Q15438 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYTH1Q15438 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYTH1Q15438 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CYTH1Q15438 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYTH1Q15438 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYTH1Q15438 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYTH1Q15438 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYTH1Q15438 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYTH1Q15438 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYTH1Q15438 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYTH1Q15438 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYTH1Q15438 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYTH1Q15438 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYTH1Q15438 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYTH1Q15438 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYTH1Q15438 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYTH1Q15438 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYTH1Q15438 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYTH1Q15438 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CYTH1Q15438 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYTH1Q15438 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYTH1Q15438 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CYTH1Q15438 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYTH1Q15438 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYTH1Q15438 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYTH1Q15438 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYTH1Q15438 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYTH1Q15438 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYTH1Q15438 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYTH1Q15438 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYTH1Q15438 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYTH1Q15438 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYTH1Q15438 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYTH1Q15438 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYTH1Q15438 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYTH1Q15438 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CYTH1Q15438 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYTH1Q15438 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYTH1Q15438 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYTH1Q15438 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYTH1Q15438 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYTH1Q15438 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYTH1Q15438 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYTH1Q15438 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYTH1Q15438 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYTH1Q15438 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CYTH1Q15438 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CYTH1Q15438 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYTH1Q15438 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYTH1Q15438 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CYTH1Q15438 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYTH1Q15438 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYTH1Q15438 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYTH1Q15438 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYTH1Q15438 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CYTH1Q15438 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms