Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
NECTIN1Q15223 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
NECTIN1Q15223 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
NECTIN1Q15223 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NECTIN1Q15223 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NECTIN1Q15223 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NECTIN1Q15223 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NECTIN1Q15223 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
NECTIN1Q15223 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NECTIN1Q15223 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NECTIN1Q15223 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NECTIN1Q15223 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NECTIN1Q15223 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NECTIN1Q15223 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NECTIN1Q15223 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NECTIN1Q15223 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NECTIN1Q15223 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NECTIN1Q15223 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NECTIN1Q15223 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NECTIN1Q15223 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NECTIN1Q15223 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NECTIN1Q15223 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NECTIN1Q15223 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NECTIN1Q15223 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NECTIN1Q15223 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NECTIN1Q15223 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NECTIN1Q15223 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NECTIN1Q15223 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NECTIN1Q15223 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NECTIN1Q15223 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NECTIN1Q15223 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NECTIN1Q15223 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
NECTIN1Q15223 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
NECTIN1Q15223 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NECTIN1Q15223 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NECTIN1Q15223 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NECTIN1Q15223 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NECTIN1Q15223 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NECTIN1Q15223 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NECTIN1Q15223 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NECTIN1Q15223 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NECTIN1Q15223 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NECTIN1Q15223 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NECTIN1Q15223 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NECTIN1Q15223 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NECTIN1Q15223 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NECTIN1Q15223 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NECTIN1Q15223 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NECTIN1Q15223 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NECTIN1Q15223 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NECTIN1Q15223 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NECTIN1Q15223 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
NECTIN1Q15223 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NECTIN1Q15223 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NECTIN1Q15223 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NECTIN1Q15223 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NECTIN1Q15223 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NECTIN1Q15223 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NECTIN1Q15223 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NECTIN1Q15223 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NECTIN1Q15223 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NECTIN1Q15223 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
NECTIN1Q15223 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NECTIN1Q15223 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NECTIN1Q15223 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NECTIN1Q15223 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NECTIN1Q15223 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NECTIN1Q15223 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NECTIN1Q15223 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NECTIN1Q15223 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NECTIN1Q15223 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NECTIN1Q15223 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NECTIN1Q15223 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NECTIN1Q15223 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NECTIN1Q15223 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
NECTIN1Q15223 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NECTIN1Q15223 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NECTIN1Q15223 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NECTIN1Q15223 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NECTIN1Q15223 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NECTIN1Q15223 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NECTIN1Q15223 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NECTIN1Q15223 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NECTIN1Q15223 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NECTIN1Q15223 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NECTIN1Q15223 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NECTIN1Q15223 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NECTIN1Q15223 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NECTIN1Q15223 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NECTIN1Q15223 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NECTIN1Q15223 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NECTIN1Q15223 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
NECTIN1Q15223 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NECTIN1Q15223 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NECTIN1Q15223 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
NECTIN1Q15223 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
NECTIN1Q15223 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NECTIN1Q15223 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NECTIN1Q15223 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NECTIN1Q15223 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
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