Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HERC3Q15034 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERC3Q15034 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERC3Q15034 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HERC3Q15034 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERC3Q15034 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERC3Q15034 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HERC3Q15034 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERC3Q15034 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERC3Q15034 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERC3Q15034 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HERC3Q15034 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERC3Q15034 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC3Q15034 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC3Q15034 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC3Q15034 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERC3Q15034 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERC3Q15034 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERC3Q15034 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HERC3Q15034 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HERC3Q15034 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HERC3Q15034 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC3Q15034 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC3Q15034 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC3Q15034 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERC3Q15034 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERC3Q15034 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERC3Q15034 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERC3Q15034 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERC3Q15034 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERC3Q15034 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERC3Q15034 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERC3Q15034 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERC3Q15034 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC3Q15034 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC3Q15034 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC3Q15034 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC3Q15034 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERC3Q15034 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERC3Q15034 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERC3Q15034 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERC3Q15034 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERC3Q15034 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERC3Q15034 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HERC3Q15034 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HERC3Q15034 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC3Q15034 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC3Q15034 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC3Q15034 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC3Q15034 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC3Q15034 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC3Q15034 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC3Q15034 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC3Q15034 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC3Q15034 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC3Q15034 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC3Q15034 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC3Q15034 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERC3Q15034 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERC3Q15034 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERC3Q15034 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HERC3Q15034 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HERC3Q15034 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC3Q15034 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC3Q15034 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC3Q15034 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC3Q15034 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC3Q15034 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERC3Q15034 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HERC3Q15034 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERC3Q15034 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC3Q15034 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC3Q15034 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC3Q15034 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERC3Q15034 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERC3Q15034 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERC3Q15034 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
HERC3Q15034 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERC3Q15034 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERC3Q15034 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HERC3Q15034 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
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