Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Traf3ip1Q149C2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Traf3ip1Q149C2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Traf3ip1Q149C2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Traf3ip1Q149C2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Traf3ip1Q149C2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Traf3ip1Q149C2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Traf3ip1Q149C2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Traf3ip1Q149C2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Traf3ip1Q149C2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Traf3ip1Q149C2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Traf3ip1Q149C2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Traf3ip1Q149C2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Traf3ip1Q149C2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Traf3ip1Q149C2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Traf3ip1Q149C2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Traf3ip1Q149C2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Traf3ip1Q149C2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Traf3ip1Q149C2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Traf3ip1Q149C2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Traf3ip1Q149C2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Traf3ip1Q149C2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Traf3ip1Q149C2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Traf3ip1Q149C2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Traf3ip1Q149C2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Traf3ip1Q149C2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Traf3ip1Q149C2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Traf3ip1Q149C2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Traf3ip1Q149C2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Traf3ip1Q149C2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Traf3ip1Q149C2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Traf3ip1Q149C2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Traf3ip1Q149C2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
Traf3ip1Q149C2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Traf3ip1Q149C2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Traf3ip1Q149C2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Traf3ip1Q149C2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Traf3ip1Q149C2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Traf3ip1Q149C2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Traf3ip1Q149C2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Traf3ip1Q149C2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Traf3ip1Q149C2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Traf3ip1Q149C2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Traf3ip1Q149C2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Traf3ip1Q149C2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Traf3ip1Q149C2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Traf3ip1Q149C2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Traf3ip1Q149C2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Traf3ip1Q149C2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Traf3ip1Q149C2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Traf3ip1Q149C2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Traf3ip1Q149C2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Traf3ip1Q149C2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Traf3ip1Q149C2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Traf3ip1Q149C2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Traf3ip1Q149C2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Traf3ip1Q149C2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Traf3ip1Q149C2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Traf3ip1Q149C2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Traf3ip1Q149C2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Traf3ip1Q149C2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Traf3ip1Q149C2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Traf3ip1Q149C2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Traf3ip1Q149C2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Traf3ip1Q149C2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Traf3ip1Q149C2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Traf3ip1Q149C2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Traf3ip1Q149C2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Traf3ip1Q149C2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Traf3ip1Q149C2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Traf3ip1Q149C2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Traf3ip1Q149C2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Traf3ip1Q149C2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Traf3ip1Q149C2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Traf3ip1Q149C2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Traf3ip1Q149C2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Traf3ip1Q149C2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Traf3ip1Q149C2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Traf3ip1Q149C2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Traf3ip1Q149C2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Traf3ip1Q149C2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Traf3ip1Q149C2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Traf3ip1Q149C2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Traf3ip1Q149C2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Traf3ip1Q149C2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Traf3ip1Q149C2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Traf3ip1Q149C2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Traf3ip1Q149C2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Traf3ip1Q149C2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Traf3ip1Q149C2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Traf3ip1Q149C2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Traf3ip1Q149C2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Traf3ip1Q149C2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Traf3ip1Q149C2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Traf3ip1Q149C2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Traf3ip1Q149C2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Traf3ip1Q149C2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Traf3ip1Q149C2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
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