Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF1Q14990 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF1Q14990 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF1Q14990 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF1Q14990 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF1Q14990 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF1Q14990 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF1Q14990 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF1Q14990 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF1Q14990 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF1Q14990 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF1Q14990 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF1Q14990 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF1Q14990 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF1Q14990 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF1Q14990 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF1Q14990 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF1Q14990 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF1Q14990 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF1Q14990 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF1Q14990 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF1Q14990 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF1Q14990 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF1Q14990 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF1Q14990 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF1Q14990 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF1Q14990 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF1Q14990 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF1Q14990 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF1Q14990 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF1Q14990 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ODF1Q14990 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF1Q14990 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF1Q14990 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF1Q14990 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF1Q14990 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF1Q14990 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF1Q14990 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF1Q14990 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF1Q14990 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF1Q14990 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF1Q14990 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF1Q14990 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF1Q14990 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF1Q14990 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF1Q14990 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF1Q14990 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF1Q14990 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODF1Q14990 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODF1Q14990 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODF1Q14990 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODF1Q14990 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODF1Q14990 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODF1Q14990 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF1Q14990 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF1Q14990 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF1Q14990 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF1Q14990 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF1Q14990 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF1Q14990 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF1Q14990 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF1Q14990 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ODF1Q14990 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ODF1Q14990 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ODF1Q14990 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF1Q14990 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF1Q14990 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF1Q14990 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF1Q14990 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF1Q14990 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF1Q14990 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF1Q14990 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF1Q14990 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF1Q14990 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF1Q14990 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF1Q14990 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF1Q14990 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF1Q14990 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF1Q14990 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF1Q14990 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF1Q14990 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF1Q14990 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF1Q14990 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF1Q14990 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF1Q14990 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF1Q14990 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF1Q14990 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF1Q14990 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF1Q14990 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF1Q14990 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF1Q14990 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF1Q14990 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF1Q14990 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF1Q14990 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF1Q14990 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF1Q14990 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF1Q14990 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF1Q14990 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF1Q14990 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODF1Q14990 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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