Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spatc1Q148B6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spatc1Q148B6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spatc1Q148B6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Spatc1Q148B6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spatc1Q148B6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spatc1Q148B6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spatc1Q148B6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spatc1Q148B6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spatc1Q148B6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spatc1Q148B6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Spatc1Q148B6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spatc1Q148B6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spatc1Q148B6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spatc1Q148B6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spatc1Q148B6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spatc1Q148B6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spatc1Q148B6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spatc1Q148B6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spatc1Q148B6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spatc1Q148B6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spatc1Q148B6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spatc1Q148B6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spatc1Q148B6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Spatc1Q148B6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spatc1Q148B6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spatc1Q148B6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spatc1Q148B6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spatc1Q148B6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spatc1Q148B6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spatc1Q148B6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spatc1Q148B6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spatc1Q148B6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spatc1Q148B6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Spatc1Q148B6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spatc1Q148B6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Spatc1Q148B6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spatc1Q148B6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spatc1Q148B6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spatc1Q148B6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spatc1Q148B6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spatc1Q148B6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spatc1Q148B6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spatc1Q148B6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spatc1Q148B6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spatc1Q148B6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spatc1Q148B6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spatc1Q148B6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spatc1Q148B6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Spatc1Q148B6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spatc1Q148B6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spatc1Q148B6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spatc1Q148B6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Spatc1Q148B6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Spatc1Q148B6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spatc1Q148B6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spatc1Q148B6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spatc1Q148B6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spatc1Q148B6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spatc1Q148B6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spatc1Q148B6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spatc1Q148B6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spatc1Q148B6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spatc1Q148B6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spatc1Q148B6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spatc1Q148B6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spatc1Q148B6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Spatc1Q148B6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spatc1Q148B6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spatc1Q148B6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spatc1Q148B6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spatc1Q148B6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spatc1Q148B6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spatc1Q148B6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spatc1Q148B6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spatc1Q148B6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spatc1Q148B6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spatc1Q148B6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spatc1Q148B6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spatc1Q148B6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spatc1Q148B6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spatc1Q148B6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spatc1Q148B6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spatc1Q148B6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spatc1Q148B6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spatc1Q148B6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Spatc1Q148B6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spatc1Q148B6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spatc1Q148B6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spatc1Q148B6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spatc1Q148B6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Spatc1Q148B6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Spatc1Q148B6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spatc1Q148B6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spatc1Q148B6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spatc1Q148B6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spatc1Q148B6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spatc1Q148B6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spatc1Q148B6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spatc1Q148B6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms