Protein–RNA interactions for Protein: Q14722

KCNAB1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB1Q14722 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNAB1Q14722 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNAB1Q14722 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNAB1Q14722 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNAB1Q14722 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNAB1Q14722 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNAB1Q14722 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNAB1Q14722 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNAB1Q14722 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNAB1Q14722 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNAB1Q14722 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNAB1Q14722 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNAB1Q14722 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNAB1Q14722 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNAB1Q14722 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNAB1Q14722 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNAB1Q14722 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNAB1Q14722 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNAB1Q14722 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNAB1Q14722 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNAB1Q14722 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNAB1Q14722 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNAB1Q14722 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNAB1Q14722 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNAB1Q14722 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNAB1Q14722 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNAB1Q14722 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNAB1Q14722 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNAB1Q14722 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNAB1Q14722 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNAB1Q14722 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNAB1Q14722 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNAB1Q14722 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNAB1Q14722 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNAB1Q14722 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNAB1Q14722 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNAB1Q14722 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNAB1Q14722 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNAB1Q14722 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNAB1Q14722 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KCNAB1Q14722 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNAB1Q14722 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNAB1Q14722 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNAB1Q14722 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNAB1Q14722 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNAB1Q14722 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNAB1Q14722 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNAB1Q14722 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNAB1Q14722 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNAB1Q14722 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNAB1Q14722 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNAB1Q14722 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNAB1Q14722 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNAB1Q14722 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNAB1Q14722 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNAB1Q14722 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNAB1Q14722 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNAB1Q14722 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNAB1Q14722 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNAB1Q14722 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNAB1Q14722 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNAB1Q14722 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KCNAB1Q14722 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNAB1Q14722 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNAB1Q14722 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNAB1Q14722 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNAB1Q14722 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNAB1Q14722 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNAB1Q14722 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNAB1Q14722 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNAB1Q14722 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNAB1Q14722 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNAB1Q14722 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNAB1Q14722 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNAB1Q14722 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNAB1Q14722 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNAB1Q14722 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNAB1Q14722 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNAB1Q14722 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNAB1Q14722 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNAB1Q14722 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNAB1Q14722 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNAB1Q14722 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNAB1Q14722 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNAB1Q14722 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNAB1Q14722 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNAB1Q14722 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNAB1Q14722 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNAB1Q14722 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNAB1Q14722 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KCNAB1Q14722 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNAB1Q14722 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNAB1Q14722 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNAB1Q14722 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNAB1Q14722 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNAB1Q14722 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNAB1Q14722 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNAB1Q14722 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNAB1Q14722 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNAB1Q14722 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms