Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RFTN1Q14699 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RFTN1Q14699 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RFTN1Q14699 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RFTN1Q14699 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RFTN1Q14699 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RFTN1Q14699 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RFTN1Q14699 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RFTN1Q14699 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RFTN1Q14699 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RFTN1Q14699 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RFTN1Q14699 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RFTN1Q14699 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RFTN1Q14699 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RFTN1Q14699 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RFTN1Q14699 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RFTN1Q14699 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RFTN1Q14699 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RFTN1Q14699 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RFTN1Q14699 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RFTN1Q14699 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RFTN1Q14699 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RFTN1Q14699 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RFTN1Q14699 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFTN1Q14699 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RFTN1Q14699 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RFTN1Q14699 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RFTN1Q14699 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RFTN1Q14699 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFTN1Q14699 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFTN1Q14699 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFTN1Q14699 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFTN1Q14699 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFTN1Q14699 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFTN1Q14699 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFTN1Q14699 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RFTN1Q14699 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFTN1Q14699 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFTN1Q14699 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFTN1Q14699 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RFTN1Q14699 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RFTN1Q14699 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFTN1Q14699 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFTN1Q14699 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RFTN1Q14699 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFTN1Q14699 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFTN1Q14699 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFTN1Q14699 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFTN1Q14699 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFTN1Q14699 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFTN1Q14699 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFTN1Q14699 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFTN1Q14699 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFTN1Q14699 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFTN1Q14699 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFTN1Q14699 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFTN1Q14699 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFTN1Q14699 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFTN1Q14699 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RFTN1Q14699 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFTN1Q14699 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RFTN1Q14699 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFTN1Q14699 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFTN1Q14699 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RFTN1Q14699 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFTN1Q14699 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFTN1Q14699 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFTN1Q14699 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFTN1Q14699 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFTN1Q14699 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFTN1Q14699 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFTN1Q14699 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFTN1Q14699 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFTN1Q14699 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RFTN1Q14699 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RFTN1Q14699 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFTN1Q14699 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFTN1Q14699 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RFTN1Q14699 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RFTN1Q14699 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RFTN1Q14699 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RFTN1Q14699 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RFTN1Q14699 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RFTN1Q14699 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFTN1Q14699 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RFTN1Q14699 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RFTN1Q14699 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RFTN1Q14699 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFTN1Q14699 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFTN1Q14699 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFTN1Q14699 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RFTN1Q14699 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFTN1Q14699 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFTN1Q14699 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFTN1Q14699 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFTN1Q14699 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RFTN1Q14699 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RFTN1Q14699 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RFTN1Q14699 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFTN1Q14699 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
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