Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPARCL1Q14515 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPARCL1Q14515 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SPARCL1Q14515 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPARCL1Q14515 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPARCL1Q14515 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPARCL1Q14515 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPARCL1Q14515 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPARCL1Q14515 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPARCL1Q14515 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SPARCL1Q14515 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPARCL1Q14515 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPARCL1Q14515 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPARCL1Q14515 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPARCL1Q14515 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPARCL1Q14515 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPARCL1Q14515 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPARCL1Q14515 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPARCL1Q14515 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPARCL1Q14515 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPARCL1Q14515 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPARCL1Q14515 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPARCL1Q14515 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPARCL1Q14515 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPARCL1Q14515 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPARCL1Q14515 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPARCL1Q14515 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPARCL1Q14515 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPARCL1Q14515 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPARCL1Q14515 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPARCL1Q14515 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPARCL1Q14515 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPARCL1Q14515 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPARCL1Q14515 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPARCL1Q14515 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPARCL1Q14515 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPARCL1Q14515 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPARCL1Q14515 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPARCL1Q14515 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPARCL1Q14515 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPARCL1Q14515 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPARCL1Q14515 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPARCL1Q14515 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPARCL1Q14515 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPARCL1Q14515 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPARCL1Q14515 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPARCL1Q14515 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPARCL1Q14515 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPARCL1Q14515 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPARCL1Q14515 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SPARCL1Q14515 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPARCL1Q14515 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPARCL1Q14515 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPARCL1Q14515 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPARCL1Q14515 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPARCL1Q14515 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPARCL1Q14515 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPARCL1Q14515 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPARCL1Q14515 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SPARCL1Q14515 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPARCL1Q14515 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPARCL1Q14515 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPARCL1Q14515 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPARCL1Q14515 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SPARCL1Q14515 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SPARCL1Q14515 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPARCL1Q14515 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPARCL1Q14515 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPARCL1Q14515 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPARCL1Q14515 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPARCL1Q14515 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPARCL1Q14515 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPARCL1Q14515 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPARCL1Q14515 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SPARCL1Q14515 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPARCL1Q14515 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPARCL1Q14515 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPARCL1Q14515 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPARCL1Q14515 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPARCL1Q14515 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPARCL1Q14515 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPARCL1Q14515 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPARCL1Q14515 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPARCL1Q14515 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPARCL1Q14515 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SPARCL1Q14515 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPARCL1Q14515 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPARCL1Q14515 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPARCL1Q14515 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPARCL1Q14515 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPARCL1Q14515 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPARCL1Q14515 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPARCL1Q14515 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPARCL1Q14515 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPARCL1Q14515 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPARCL1Q14515 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPARCL1Q14515 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPARCL1Q14515 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SPARCL1Q14515 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPARCL1Q14515 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
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