Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSHL1Q14406 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSHL1Q14406 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CSHL1Q14406 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSHL1Q14406 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSHL1Q14406 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSHL1Q14406 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CSHL1Q14406 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CSHL1Q14406 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSHL1Q14406 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSHL1Q14406 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSHL1Q14406 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CSHL1Q14406 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSHL1Q14406 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSHL1Q14406 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSHL1Q14406 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSHL1Q14406 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSHL1Q14406 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CSHL1Q14406 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CSHL1Q14406 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSHL1Q14406 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSHL1Q14406 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSHL1Q14406 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSHL1Q14406 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSHL1Q14406 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSHL1Q14406 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSHL1Q14406 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSHL1Q14406 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSHL1Q14406 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSHL1Q14406 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSHL1Q14406 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSHL1Q14406 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSHL1Q14406 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CSHL1Q14406 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSHL1Q14406 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSHL1Q14406 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSHL1Q14406 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSHL1Q14406 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSHL1Q14406 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSHL1Q14406 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSHL1Q14406 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSHL1Q14406 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSHL1Q14406 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSHL1Q14406 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSHL1Q14406 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSHL1Q14406 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSHL1Q14406 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSHL1Q14406 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSHL1Q14406 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSHL1Q14406 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSHL1Q14406 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSHL1Q14406 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSHL1Q14406 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSHL1Q14406 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSHL1Q14406 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSHL1Q14406 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSHL1Q14406 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSHL1Q14406 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSHL1Q14406 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSHL1Q14406 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CSHL1Q14406 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CSHL1Q14406 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CSHL1Q14406 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSHL1Q14406 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSHL1Q14406 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSHL1Q14406 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSHL1Q14406 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSHL1Q14406 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSHL1Q14406 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSHL1Q14406 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSHL1Q14406 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSHL1Q14406 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSHL1Q14406 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSHL1Q14406 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSHL1Q14406 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSHL1Q14406 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSHL1Q14406 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSHL1Q14406 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSHL1Q14406 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSHL1Q14406 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSHL1Q14406 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSHL1Q14406 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CSHL1Q14406 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSHL1Q14406 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSHL1Q14406 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSHL1Q14406 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSHL1Q14406 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSHL1Q14406 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSHL1Q14406 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSHL1Q14406 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CSHL1Q14406 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSHL1Q14406 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CSHL1Q14406 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSHL1Q14406 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSHL1Q14406 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSHL1Q14406 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSHL1Q14406 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSHL1Q14406 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSHL1Q14406 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSHL1Q14406 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
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