Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TNFAIP1Q13829 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
TNFAIP1Q13829 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
TNFAIP1Q13829 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNFAIP1Q13829 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNFAIP1Q13829 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNFAIP1Q13829 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNFAIP1Q13829 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNFAIP1Q13829 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNFAIP1Q13829 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNFAIP1Q13829 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNFAIP1Q13829 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNFAIP1Q13829 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TNFAIP1Q13829 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNFAIP1Q13829 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNFAIP1Q13829 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNFAIP1Q13829 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNFAIP1Q13829 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TNFAIP1Q13829 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNFAIP1Q13829 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNFAIP1Q13829 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNFAIP1Q13829 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TNFAIP1Q13829 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
TNFAIP1Q13829 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
TNFAIP1Q13829 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
TNFAIP1Q13829 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
TNFAIP1Q13829 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
TNFAIP1Q13829 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
TNFAIP1Q13829 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TNFAIP1Q13829 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TNFAIP1Q13829 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TNFAIP1Q13829 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TNFAIP1Q13829 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
TNFAIP1Q13829 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TNFAIP1Q13829 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
TNFAIP1Q13829 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TNFAIP1Q13829 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TNFAIP1Q13829 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
TNFAIP1Q13829 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TNFAIP1Q13829 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TNFAIP1Q13829 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TNFAIP1Q13829 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TNFAIP1Q13829 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TNFAIP1Q13829 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TNFAIP1Q13829 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TNFAIP1Q13829 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TNFAIP1Q13829 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TNFAIP1Q13829 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TNFAIP1Q13829 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TNFAIP1Q13829 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TNFAIP1Q13829 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TNFAIP1Q13829 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TNFAIP1Q13829 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TNFAIP1Q13829 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TNFAIP1Q13829 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TNFAIP1Q13829 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TNFAIP1Q13829 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TNFAIP1Q13829 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TNFAIP1Q13829 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
TNFAIP1Q13829 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TNFAIP1Q13829 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TNFAIP1Q13829 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TNFAIP1Q13829 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TNFAIP1Q13829 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TNFAIP1Q13829 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TNFAIP1Q13829 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNFAIP1Q13829 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNFAIP1Q13829 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNFAIP1Q13829 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNFAIP1Q13829 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNFAIP1Q13829 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TNFAIP1Q13829 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TNFAIP1Q13829 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNFAIP1Q13829 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNFAIP1Q13829 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNFAIP1Q13829 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNFAIP1Q13829 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNFAIP1Q13829 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNFAIP1Q13829 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNFAIP1Q13829 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNFAIP1Q13829 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms