Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTAN1Q13813 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPTAN1Q13813 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPTAN1Q13813 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPTAN1Q13813 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPTAN1Q13813 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPTAN1Q13813 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPTAN1Q13813 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPTAN1Q13813 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPTAN1Q13813 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPTAN1Q13813 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPTAN1Q13813 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPTAN1Q13813 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPTAN1Q13813 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPTAN1Q13813 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPTAN1Q13813 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPTAN1Q13813 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPTAN1Q13813 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPTAN1Q13813 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPTAN1Q13813 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPTAN1Q13813 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPTAN1Q13813 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPTAN1Q13813 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SPTAN1Q13813 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPTAN1Q13813 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPTAN1Q13813 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPTAN1Q13813 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPTAN1Q13813 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPTAN1Q13813 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTAN1Q13813 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTAN1Q13813 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTAN1Q13813 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTAN1Q13813 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTAN1Q13813 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTAN1Q13813 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPTAN1Q13813 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPTAN1Q13813 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTAN1Q13813 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTAN1Q13813 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTAN1Q13813 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPTAN1Q13813 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPTAN1Q13813 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTAN1Q13813 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTAN1Q13813 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTAN1Q13813 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTAN1Q13813 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTAN1Q13813 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTAN1Q13813 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTAN1Q13813 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTAN1Q13813 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTAN1Q13813 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTAN1Q13813 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTAN1Q13813 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
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