Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRPF4BQ13523 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRPF4BQ13523 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRPF4BQ13523 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRPF4BQ13523 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRPF4BQ13523 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRPF4BQ13523 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRPF4BQ13523 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRPF4BQ13523 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRPF4BQ13523 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PRPF4BQ13523 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRPF4BQ13523 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRPF4BQ13523 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRPF4BQ13523 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRPF4BQ13523 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRPF4BQ13523 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRPF4BQ13523 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRPF4BQ13523 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRPF4BQ13523 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRPF4BQ13523 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRPF4BQ13523 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRPF4BQ13523 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRPF4BQ13523 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRPF4BQ13523 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRPF4BQ13523 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRPF4BQ13523 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRPF4BQ13523 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRPF4BQ13523 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRPF4BQ13523 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRPF4BQ13523 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRPF4BQ13523 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRPF4BQ13523 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRPF4BQ13523 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRPF4BQ13523 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRPF4BQ13523 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRPF4BQ13523 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PRPF4BQ13523 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRPF4BQ13523 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PRPF4BQ13523 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRPF4BQ13523 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PRPF4BQ13523 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRPF4BQ13523 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRPF4BQ13523 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRPF4BQ13523 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRPF4BQ13523 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRPF4BQ13523 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRPF4BQ13523 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRPF4BQ13523 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRPF4BQ13523 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRPF4BQ13523 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRPF4BQ13523 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRPF4BQ13523 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRPF4BQ13523 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRPF4BQ13523 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRPF4BQ13523 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRPF4BQ13523 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PRPF4BQ13523 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRPF4BQ13523 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRPF4BQ13523 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRPF4BQ13523 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRPF4BQ13523 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRPF4BQ13523 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRPF4BQ13523 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRPF4BQ13523 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRPF4BQ13523 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRPF4BQ13523 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRPF4BQ13523 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRPF4BQ13523 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRPF4BQ13523 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRPF4BQ13523 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRPF4BQ13523 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRPF4BQ13523 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRPF4BQ13523 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRPF4BQ13523 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRPF4BQ13523 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRPF4BQ13523 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRPF4BQ13523 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPF4BQ13523 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PRPF4BQ13523 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
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