Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBB3Q13509 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBB3Q13509 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBB3Q13509 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBB3Q13509 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBB3Q13509 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBB3Q13509 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBB3Q13509 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBB3Q13509 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBB3Q13509 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBB3Q13509 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBB3Q13509 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBB3Q13509 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBB3Q13509 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBB3Q13509 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBB3Q13509 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBB3Q13509 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBB3Q13509 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBB3Q13509 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBB3Q13509 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBB3Q13509 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBB3Q13509 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBB3Q13509 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBB3Q13509 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBB3Q13509 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBB3Q13509 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TUBB3Q13509 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUBB3Q13509 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBB3Q13509 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBB3Q13509 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBB3Q13509 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBB3Q13509 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBB3Q13509 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBB3Q13509 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBB3Q13509 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBB3Q13509 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBB3Q13509 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBB3Q13509 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBB3Q13509 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBB3Q13509 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBB3Q13509 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBB3Q13509 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBB3Q13509 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBB3Q13509 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBB3Q13509 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBB3Q13509 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBB3Q13509 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBB3Q13509 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBB3Q13509 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBB3Q13509 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBB3Q13509 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBB3Q13509 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBB3Q13509 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TUBB3Q13509 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBB3Q13509 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBB3Q13509 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBB3Q13509 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBB3Q13509 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUBB3Q13509 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUBB3Q13509 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBB3Q13509 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBB3Q13509 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBB3Q13509 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBB3Q13509 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBB3Q13509 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBB3Q13509 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBB3Q13509 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBB3Q13509 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBB3Q13509 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBB3Q13509 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBB3Q13509 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBB3Q13509 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBB3Q13509 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBB3Q13509 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBB3Q13509 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBB3Q13509 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBB3Q13509 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBB3Q13509 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBB3Q13509 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBB3Q13509 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBB3Q13509 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBB3Q13509 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBB3Q13509 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBB3Q13509 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBB3Q13509 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBB3Q13509 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBB3Q13509 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBB3Q13509 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBB3Q13509 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBB3Q13509 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBB3Q13509 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBB3Q13509 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBB3Q13509 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBB3Q13509 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TUBB3Q13509 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TUBB3Q13509 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBB3Q13509 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBB3Q13509 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBB3Q13509 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBB3Q13509 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
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