Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK5R2Q13319 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5R2Q13319 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5R2Q13319 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5R2Q13319 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5R2Q13319 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5R2Q13319 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5R2Q13319 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK5R2Q13319 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK5R2Q13319 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK5R2Q13319 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK5R2Q13319 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK5R2Q13319 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK5R2Q13319 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK5R2Q13319 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK5R2Q13319 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5R2Q13319 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5R2Q13319 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5R2Q13319 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5R2Q13319 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK5R2Q13319 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK5R2Q13319 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK5R2Q13319 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK5R2Q13319 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK5R2Q13319 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK5R2Q13319 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK5R2Q13319 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK5R2Q13319 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK5R2Q13319 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK5R2Q13319 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK5R2Q13319 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK5R2Q13319 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK5R2Q13319 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK5R2Q13319 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK5R2Q13319 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK5R2Q13319 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5R2Q13319 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK5R2Q13319 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK5R2Q13319 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK5R2Q13319 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK5R2Q13319 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK5R2Q13319 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK5R2Q13319 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK5R2Q13319 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK5R2Q13319 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK5R2Q13319 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK5R2Q13319 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK5R2Q13319 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK5R2Q13319 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDK5R2Q13319 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK5R2Q13319 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK5R2Q13319 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK5R2Q13319 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK5R2Q13319 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK5R2Q13319 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK5R2Q13319 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK5R2Q13319 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK5R2Q13319 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK5R2Q13319 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK5R2Q13319 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK5R2Q13319 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5R2Q13319 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5R2Q13319 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5R2Q13319 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK5R2Q13319 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK5R2Q13319 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK5R2Q13319 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5R2Q13319 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5R2Q13319 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5R2Q13319 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5R2Q13319 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5R2Q13319 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK5R2Q13319 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK5R2Q13319 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK5R2Q13319 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK5R2Q13319 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK5R2Q13319 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK5R2Q13319 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK5R2Q13319 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK5R2Q13319 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK5R2Q13319 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK5R2Q13319 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK5R2Q13319 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK5R2Q13319 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK5R2Q13319 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK5R2Q13319 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5R2Q13319 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5R2Q13319 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5R2Q13319 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK5R2Q13319 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK5R2Q13319 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5R2Q13319 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5R2Q13319 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5R2Q13319 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5R2Q13319 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5R2Q13319 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK5R2Q13319 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK5R2Q13319 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5R2Q13319 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5R2Q13319 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms