Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CDC16Q13042 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDC16Q13042 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC16Q13042 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC16Q13042 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC16Q13042 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC16Q13042 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC16Q13042 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC16Q13042 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC16Q13042 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC16Q13042 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC16Q13042 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC16Q13042 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC16Q13042 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC16Q13042 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC16Q13042 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC16Q13042 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC16Q13042 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC16Q13042 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC16Q13042 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC16Q13042 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDC16Q13042 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDC16Q13042 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC16Q13042 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC16Q13042 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC16Q13042 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC16Q13042 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC16Q13042 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC16Q13042 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC16Q13042 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC16Q13042 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC16Q13042 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC16Q13042 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC16Q13042 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC16Q13042 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC16Q13042 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC16Q13042 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CDC16Q13042 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC16Q13042 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC16Q13042 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC16Q13042 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC16Q13042 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC16Q13042 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC16Q13042 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC16Q13042 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC16Q13042 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC16Q13042 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC16Q13042 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC16Q13042 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC16Q13042 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC16Q13042 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC16Q13042 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC16Q13042 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC16Q13042 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC16Q13042 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CDC16Q13042 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDC16Q13042 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC16Q13042 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC16Q13042 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC16Q13042 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC16Q13042 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC16Q13042 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC16Q13042 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC16Q13042 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC16Q13042 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC16Q13042 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC16Q13042 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDC16Q13042 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDC16Q13042 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDC16Q13042 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDC16Q13042 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDC16Q13042 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDC16Q13042 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDC16Q13042 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDC16Q13042 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC16Q13042 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC16Q13042 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC16Q13042 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC16Q13042 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC16Q13042 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDC16Q13042 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDC16Q13042 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDC16Q13042 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CDC16Q13042 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
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