Protein–RNA interactions for Protein: Q12834

CDC20, Cell division cycle protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC20Q12834 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC20Q12834 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC20Q12834 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC20Q12834 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC20Q12834 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC20Q12834 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC20Q12834 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC20Q12834 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC20Q12834 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC20Q12834 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC20Q12834 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC20Q12834 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC20Q12834 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC20Q12834 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC20Q12834 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC20Q12834 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC20Q12834 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC20Q12834 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC20Q12834 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC20Q12834 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC20Q12834 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC20Q12834 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC20Q12834 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC20Q12834 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC20Q12834 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC20Q12834 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC20Q12834 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC20Q12834 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC20Q12834 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC20Q12834 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC20Q12834 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC20Q12834 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC20Q12834 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CDC20Q12834 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC20Q12834 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC20Q12834 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC20Q12834 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC20Q12834 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC20Q12834 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC20Q12834 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC20Q12834 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC20Q12834 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC20Q12834 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC20Q12834 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC20Q12834 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC20Q12834 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC20Q12834 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC20Q12834 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC20Q12834 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC20Q12834 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC20Q12834 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC20Q12834 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC20Q12834 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC20Q12834 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC20Q12834 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC20Q12834 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC20Q12834 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC20Q12834 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC20Q12834 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC20Q12834 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC20Q12834 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC20Q12834 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC20Q12834 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC20Q12834 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC20Q12834 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC20Q12834 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC20Q12834 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC20Q12834 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC20Q12834 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC20Q12834 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC20Q12834 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC20Q12834 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC20Q12834 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC20Q12834 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC20Q12834 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDC20Q12834 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC20Q12834 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC20Q12834 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC20Q12834 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC20Q12834 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC20Q12834 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC20Q12834 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC20Q12834 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC20Q12834 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC20Q12834 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC20Q12834 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC20Q12834 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC20Q12834 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC20Q12834 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC20Q12834 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC20Q12834 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC20Q12834 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC20Q12834 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC20Q12834 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC20Q12834 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC20Q12834 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC20Q12834 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC20Q12834 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC20Q12834 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC20Q12834 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms