Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
ARHGEF5Q12774 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC40.85■■■■■ 4.13
ARHGEF5Q12774 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
ARHGEF5Q12774 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
ARHGEF5Q12774 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
ARHGEF5Q12774 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC40.82■■■■■ 4.13
ARHGEF5Q12774 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.12
ARHGEF5Q12774 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
ARHGEF5Q12774 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
ARHGEF5Q12774 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
ARHGEF5Q12774 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
ARHGEF5Q12774 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
ARHGEF5Q12774 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
ARHGEF5Q12774 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
ARHGEF5Q12774 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
ARHGEF5Q12774 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
ARHGEF5Q12774 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
ARHGEF5Q12774 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
ARHGEF5Q12774 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
ARHGEF5Q12774 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC40.76■■■■■ 4.12
ARHGEF5Q12774 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
ARHGEF5Q12774 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.11
ARHGEF5Q12774 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
ARHGEF5Q12774 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
ARHGEF5Q12774 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
ARHGEF5Q12774 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
ARHGEF5Q12774 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
ARHGEF5Q12774 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC40.72■■■■■ 4.11
ARHGEF5Q12774 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
ARHGEF5Q12774 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
ARHGEF5Q12774 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
ARHGEF5Q12774 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
ARHGEF5Q12774 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
ARHGEF5Q12774 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
ARHGEF5Q12774 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
ARHGEF5Q12774 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
ARHGEF5Q12774 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
ARHGEF5Q12774 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
ARHGEF5Q12774 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
ARHGEF5Q12774 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
ARHGEF5Q12774 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
ARHGEF5Q12774 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
ARHGEF5Q12774 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
ARHGEF5Q12774 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
ARHGEF5Q12774 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
ARHGEF5Q12774 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
ARHGEF5Q12774 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
ARHGEF5Q12774 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
ARHGEF5Q12774 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
ARHGEF5Q12774 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
ARHGEF5Q12774 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
ARHGEF5Q12774 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
ARHGEF5Q12774 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
ARHGEF5Q12774 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
ARHGEF5Q12774 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
ARHGEF5Q12774 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
ARHGEF5Q12774 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
ARHGEF5Q12774 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
ARHGEF5Q12774 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
ARHGEF5Q12774 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
ARHGEF5Q12774 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
ARHGEF5Q12774 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
ARHGEF5Q12774 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
ARHGEF5Q12774 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
ARHGEF5Q12774 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
ARHGEF5Q12774 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC40.45■■■■■ 4.07
ARHGEF5Q12774 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
ARHGEF5Q12774 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
ARHGEF5Q12774 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
ARHGEF5Q12774 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
ARHGEF5Q12774 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
ARHGEF5Q12774 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
ARHGEF5Q12774 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
ARHGEF5Q12774 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
ARHGEF5Q12774 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
ARHGEF5Q12774 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
ARHGEF5Q12774 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
ARHGEF5Q12774 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
ARHGEF5Q12774 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
ARHGEF5Q12774 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
ARHGEF5Q12774 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
ARHGEF5Q12774 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
ARHGEF5Q12774 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC40.37■■■■■ 4.05
ARHGEF5Q12774 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC40.37■■■■■ 4.05
ARHGEF5Q12774 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
ARHGEF5Q12774 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
ARHGEF5Q12774 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
ARHGEF5Q12774 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
ARHGEF5Q12774 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.35■■■■■ 4.05
ARHGEF5Q12774 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
ARHGEF5Q12774 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
ARHGEF5Q12774 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
ARHGEF5Q12774 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
ARHGEF5Q12774 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
ARHGEF5Q12774 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
ARHGEF5Q12774 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
ARHGEF5Q12774 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
ARHGEF5Q12774 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC40.27■■■■■ 4.04
ARHGEF5Q12774 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
ARHGEF5Q12774 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms