Protein–RNA interactions for Protein: Q12006

PFA4, Palmitoyltransferase PFA4, yeastyeast

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PFA4Q12006 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.88□□□□□ -0.99
PFA4Q12006 ESS1YJR017C 513 nt8.88□□□□□ -0.99
PFA4Q12006 YJL118WYJL118W 660 nt8.87□□□□□ -0.99
PFA4Q12006 ALG12YNR030W 1656 nt8.87□□□□□ -0.99
PFA4Q12006 SAM3YPL274W 1764 nt8.86□□□□□ -0.99
PFA4Q12006 BNI5YNL166C 1347 nt8.85□□□□□ -0.99
PFA4Q12006 PHO23YNL097C 993 nt8.85□□□□□ -0.99
PFA4Q12006 CCT5YJR064W 1689 nt8.85□□□□□ -0.99
PFA4Q12006 GAL3YDR009W 1563 nt8.84□□□□□ -0.99
PFA4Q12006 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt8.84□□□□□ -0.99
PFA4Q12006 LSB5YCL034W 1065 nt8.84□□□□□ -0.99
PFA4Q12006 MSC1YML128C 1542 nt8.82□□□□□ -1
PFA4Q12006 URA6YKL024C 615 nt8.81□□□□□ -1
PFA4Q12006 OYE3YPL171C 1203 nt8.81□□□□□ -1
PFA4Q12006 RPT5YOR117W 1305 nt8.8□□□□□ -1
PFA4Q12006 NUC1YJL208C 990 nt8.8□□□□□ -1
PFA4Q12006 PGC1YPL206C 966 nt8.79□□□□□ -1
PFA4Q12006 ZRT3YKL175W 1512 nt8.78□□□□□ -1
PFA4Q12006 SNZ1YMR096W 894 nt8.77□□□□□ -1.01
PFA4Q12006 SEC61YLR378C 1443 nt8.77□□□□□ -1.01
PFA4Q12006 SAM2YDR502C 1155 nt8.76□□□□□ -1.01
PFA4Q12006 OXA1YER154W 1209 nt8.76□□□□□ -1.01
PFA4Q12006 PBP1YGR178C 2169 nt8.75□□□□□ -1.01
PFA4Q12006 FUB1YCR076C 753 nt8.75□□□□□ -1.01
PFA4Q12006 PAU5YFL020C 369 nt8.75□□□□□ -1.01
PFA4Q12006 RIB7YBR153W 735 nt8.74□□□□□ -1.01
PFA4Q12006 THI72YOR192C 1800 nt8.74□□□□□ -1.01
PFA4Q12006 FLR1YBR008C 1647 nt8.73□□□□□ -1.01
PFA4Q12006 YER188WYER188W 720 nt8.73□□□□□ -1.01
PFA4Q12006 YJL067WYJL067W 351 nt8.73□□□□□ -1.01
PFA4Q12006 PET8YNL003C 855 nt8.73□□□□□ -1.01
PFA4Q12006 TPS1YBR126C 1488 nt8.72□□□□□ -1.01
PFA4Q12006 YBR232CYBR232C 360 nt8.72□□□□□ -1.01
PFA4Q12006 SEN2YLR105C 1134 nt8.71□□□□□ -1.02
PFA4Q12006 OYE2YHR179W 1203 nt8.7□□□□□ -1.02
PFA4Q12006 DLD2YDL178W 1593 nt8.69□□□□□ -1.02
PFA4Q12006 RAS2YNL098C 969 nt8.69□□□□□ -1.02
PFA4Q12006 EAF3YPR023C 1206 nt8.69□□□□□ -1.02
PFA4Q12006 YPR126CYPR126C 309 nt8.69□□□□□ -1.02
PFA4Q12006 STP3YLR375W 1032 nt8.68□□□□□ -1.02
PFA4Q12006 CYT2YKL087C 675 nt8.67□□□□□ -1.02
PFA4Q12006 TAF13YML098W 504 nt8.67□□□□□ -1.02
PFA4Q12006 NAR1YNL240C 1476 nt8.67□□□□□ -1.02
PFA4Q12006 RSC8YFR037C 1674 nt8.66□□□□□ -1.02
PFA4Q12006 YPS3YLR121C 1527 nt8.66□□□□□ -1.02
PFA4Q12006 FMS1YMR020W 1527 nt8.66□□□□□ -1.02
PFA4Q12006 PUP1YOR157C 786 nt8.66□□□□□ -1.02
PFA4Q12006 DAK2YFL053W 1776 nt8.65□□□□□ -1.02
PFA4Q12006 NAP1YKR048C 1254 nt8.64□□□□□ -1.03
PFA4Q12006 YMR262WYMR262W 942 nt8.64□□□□□ -1.03
PFA4Q12006 HEM13YDR044W 987 nt8.62□□□□□ -1.03
PFA4Q12006 TMA23YMR269W 636 nt8.62□□□□□ -1.03
PFA4Q12006 MHF1YOL086W-A 273 nt8.62□□□□□ -1.03
PFA4Q12006 CTI6YPL181W 1521 nt8.61□□□□□ -1.03
PFA4Q12006 SPP2YOR148C 558 nt8.61□□□□□ -1.03
PFA4Q12006 NME1NME1 340 nt8.61□□□□□ -1.03
PFA4Q12006 OSH7YHR001W 1314 nt8.6□□□□□ -1.03
PFA4Q12006 DDI1YER143W 1287 nt8.6□□□□□ -1.03
PFA4Q12006 YJL064WYJL064W 396 nt8.6□□□□□ -1.03
PFA4Q12006 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8.59□□□□□ -1.03
PFA4Q12006 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8.59□□□□□ -1.03
PFA4Q12006 ACH1YBL015W 1581 nt8.58□□□□□ -1.04
PFA4Q12006 SOL2YCR073W-A 948 nt8.58□□□□□ -1.04
PFA4Q12006 POT1YIL160C 1254 nt8.58□□□□□ -1.04
PFA4Q12006 APS2YJR058C 444 nt8.58□□□□□ -1.04
PFA4Q12006 CWC15YDR163W 528 nt8.57□□□□□ -1.04
PFA4Q12006 PAU19YMR325W 375 nt8.57□□□□□ -1.04
PFA4Q12006 TAT2YOL020W 1779 nt8.57□□□□□ -1.04
PFA4Q12006 IML3YBR107C 738 nt8.56□□□□□ -1.04
PFA4Q12006 TUB4YLR212C 1422 nt8.55□□□□□ -1.04
PFA4Q12006 YAT1YAR035W 2064 nt8.55□□□□□ -1.04
PFA4Q12006 YDR455CYDR455C 309 nt8.55□□□□□ -1.04
PFA4Q12006 GSF2YML048W 1212 nt8.55□□□□□ -1.04
PFA4Q12006 LSM5YER146W 282 nt8.54□□□□□ -1.04
PFA4Q12006 NIF3YGL221C 867 nt8.54□□□□□ -1.04
PFA4Q12006 IMO32YGR031W 1029 nt8.54□□□□□ -1.04
PFA4Q12006 YNL024CYNL024C 741 nt8.54□□□□□ -1.04
PFA4Q12006 PAR32YDL173W 888 nt8.53□□□□□ -1.04
PFA4Q12006 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt8.5□□□□□ -1.05
PFA4Q12006 SPS100YHR139C 981 nt8.48□□□□□ -1.05
PFA4Q12006 RRT8YOL048C 1029 nt8.47□□□□□ -1.05
PFA4Q12006 SLG1YOR008C 1137 nt8.47□□□□□ -1.05
PFA4Q12006 VPS62YGR141W 1404 nt8.46□□□□□ -1.06
PFA4Q12006 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.45□□□□□ -1.06
PFA4Q12006 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.45□□□□□ -1.06
PFA4Q12006 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.45□□□□□ -1.06
PFA4Q12006 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.45□□□□□ -1.06
PFA4Q12006 CDD1YLR245C 429 nt8.45□□□□□ -1.06
PFA4Q12006 ERG13YML126C 1476 nt8.45□□□□□ -1.06
PFA4Q12006 RPC82YPR190C 1965 nt8.44□□□□□ -1.06
PFA4Q12006 ADE8YDR408C 645 nt8.44□□□□□ -1.06
PFA4Q12006 CMP2YML057W 1815 nt8.44□□□□□ -1.06
PFA4Q12006 INA1YLR413W 2028 nt8.44□□□□□ -1.06
PFA4Q12006 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.43□□□□□ -1.06
PFA4Q12006 TIP1YBR067C 633 nt8.43□□□□□ -1.06
PFA4Q12006 HSL7YBR133C 2484 nt8.42□□□□□ -1.06
PFA4Q12006 YDL086WYDL086W 822 nt8.41□□□□□ -1.06
PFA4Q12006 IGD1YFR017C 588 nt8.41□□□□□ -1.06
PFA4Q12006 NAS2YIL007C 663 nt8.41□□□□□ -1.06
PFA4Q12006 TIM44YIL022W 1296 nt8.4□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 6.6 ms