Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
APOBRQ0VD83 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
APOBRQ0VD83 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
APOBRQ0VD83 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
APOBRQ0VD83 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
APOBRQ0VD83 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
APOBRQ0VD83 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
APOBRQ0VD83 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
APOBRQ0VD83 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
APOBRQ0VD83 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
APOBRQ0VD83 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
APOBRQ0VD83 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
APOBRQ0VD83 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
APOBRQ0VD83 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
APOBRQ0VD83 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
APOBRQ0VD83 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
APOBRQ0VD83 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
APOBRQ0VD83 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
APOBRQ0VD83 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
APOBRQ0VD83 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
APOBRQ0VD83 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
APOBRQ0VD83 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
APOBRQ0VD83 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
APOBRQ0VD83 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
APOBRQ0VD83 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
APOBRQ0VD83 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
APOBRQ0VD83 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
APOBRQ0VD83 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
APOBRQ0VD83 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
APOBRQ0VD83 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
APOBRQ0VD83 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
APOBRQ0VD83 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
APOBRQ0VD83 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
APOBRQ0VD83 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
APOBRQ0VD83 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
APOBRQ0VD83 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
APOBRQ0VD83 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
APOBRQ0VD83 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
APOBRQ0VD83 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
APOBRQ0VD83 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
APOBRQ0VD83 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
APOBRQ0VD83 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
APOBRQ0VD83 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
APOBRQ0VD83 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
APOBRQ0VD83 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
APOBRQ0VD83 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
APOBRQ0VD83 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
APOBRQ0VD83 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
APOBRQ0VD83 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
APOBRQ0VD83 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
APOBRQ0VD83 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
APOBRQ0VD83 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
APOBRQ0VD83 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
APOBRQ0VD83 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
APOBRQ0VD83 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
APOBRQ0VD83 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
APOBRQ0VD83 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
APOBRQ0VD83 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
APOBRQ0VD83 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
APOBRQ0VD83 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
APOBRQ0VD83 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
APOBRQ0VD83 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
APOBRQ0VD83 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
APOBRQ0VD83 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
APOBRQ0VD83 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
APOBRQ0VD83 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
APOBRQ0VD83 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
APOBRQ0VD83 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
APOBRQ0VD83 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
APOBRQ0VD83 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
APOBRQ0VD83 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
APOBRQ0VD83 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
APOBRQ0VD83 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
APOBRQ0VD83 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
APOBRQ0VD83 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
APOBRQ0VD83 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
APOBRQ0VD83 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
APOBRQ0VD83 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
APOBRQ0VD83 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
APOBRQ0VD83 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
APOBRQ0VD83 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
APOBRQ0VD83 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
APOBRQ0VD83 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
APOBRQ0VD83 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
APOBRQ0VD83 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
APOBRQ0VD83 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
APOBRQ0VD83 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
APOBRQ0VD83 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
APOBRQ0VD83 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
APOBRQ0VD83 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
APOBRQ0VD83 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
APOBRQ0VD83 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
APOBRQ0VD83 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
APOBRQ0VD83 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
APOBRQ0VD83 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31■■■□□ 2.55
APOBRQ0VD83 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
APOBRQ0VD83 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
APOBRQ0VD83 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
APOBRQ0VD83 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
APOBRQ0VD83 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms