Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shisal1Q0VBP7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shisal1Q0VBP7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shisal1Q0VBP7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shisal1Q0VBP7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shisal1Q0VBP7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shisal1Q0VBP7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shisal1Q0VBP7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shisal1Q0VBP7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shisal1Q0VBP7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shisal1Q0VBP7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shisal1Q0VBP7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shisal1Q0VBP7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shisal1Q0VBP7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shisal1Q0VBP7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shisal1Q0VBP7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shisal1Q0VBP7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shisal1Q0VBP7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shisal1Q0VBP7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shisal1Q0VBP7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shisal1Q0VBP7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shisal1Q0VBP7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shisal1Q0VBP7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shisal1Q0VBP7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Shisal1Q0VBP7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Shisal1Q0VBP7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Shisal1Q0VBP7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Shisal1Q0VBP7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Shisal1Q0VBP7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Shisal1Q0VBP7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Shisal1Q0VBP7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Shisal1Q0VBP7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Shisal1Q0VBP7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Shisal1Q0VBP7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Shisal1Q0VBP7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Shisal1Q0VBP7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Shisal1Q0VBP7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Shisal1Q0VBP7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Shisal1Q0VBP7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shisal1Q0VBP7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shisal1Q0VBP7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shisal1Q0VBP7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shisal1Q0VBP7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shisal1Q0VBP7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shisal1Q0VBP7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shisal1Q0VBP7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shisal1Q0VBP7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shisal1Q0VBP7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shisal1Q0VBP7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shisal1Q0VBP7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shisal1Q0VBP7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shisal1Q0VBP7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shisal1Q0VBP7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shisal1Q0VBP7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shisal1Q0VBP7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Shisal1Q0VBP7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shisal1Q0VBP7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Shisal1Q0VBP7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shisal1Q0VBP7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shisal1Q0VBP7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shisal1Q0VBP7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shisal1Q0VBP7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shisal1Q0VBP7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shisal1Q0VBP7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shisal1Q0VBP7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shisal1Q0VBP7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shisal1Q0VBP7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shisal1Q0VBP7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shisal1Q0VBP7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Shisal1Q0VBP7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shisal1Q0VBP7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shisal1Q0VBP7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shisal1Q0VBP7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shisal1Q0VBP7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shisal1Q0VBP7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shisal1Q0VBP7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Shisal1Q0VBP7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shisal1Q0VBP7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shisal1Q0VBP7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shisal1Q0VBP7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shisal1Q0VBP7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shisal1Q0VBP7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shisal1Q0VBP7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shisal1Q0VBP7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shisal1Q0VBP7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shisal1Q0VBP7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shisal1Q0VBP7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Shisal1Q0VBP7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Shisal1Q0VBP7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shisal1Q0VBP7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shisal1Q0VBP7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shisal1Q0VBP7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shisal1Q0VBP7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shisal1Q0VBP7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shisal1Q0VBP7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shisal1Q0VBP7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shisal1Q0VBP7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shisal1Q0VBP7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shisal1Q0VBP7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shisal1Q0VBP7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms