Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab42Q0PD08 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab42Q0PD08 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab42Q0PD08 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab42Q0PD08 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab42Q0PD08 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab42Q0PD08 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab42Q0PD08 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab42Q0PD08 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab42Q0PD08 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab42Q0PD08 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab42Q0PD08 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab42Q0PD08 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab42Q0PD08 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab42Q0PD08 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab42Q0PD08 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab42Q0PD08 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab42Q0PD08 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab42Q0PD08 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab42Q0PD08 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab42Q0PD08 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab42Q0PD08 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab42Q0PD08 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab42Q0PD08 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab42Q0PD08 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab42Q0PD08 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab42Q0PD08 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab42Q0PD08 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab42Q0PD08 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab42Q0PD08 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab42Q0PD08 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab42Q0PD08 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab42Q0PD08 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab42Q0PD08 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab42Q0PD08 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab42Q0PD08 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rab42Q0PD08 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Rab42Q0PD08 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab42Q0PD08 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab42Q0PD08 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab42Q0PD08 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab42Q0PD08 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab42Q0PD08 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab42Q0PD08 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab42Q0PD08 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab42Q0PD08 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab42Q0PD08 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab42Q0PD08 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab42Q0PD08 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab42Q0PD08 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab42Q0PD08 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab42Q0PD08 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab42Q0PD08 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab42Q0PD08 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab42Q0PD08 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab42Q0PD08 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab42Q0PD08 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab42Q0PD08 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab42Q0PD08 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab42Q0PD08 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab42Q0PD08 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab42Q0PD08 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab42Q0PD08 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab42Q0PD08 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab42Q0PD08 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab42Q0PD08 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab42Q0PD08 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab42Q0PD08 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab42Q0PD08 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab42Q0PD08 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab42Q0PD08 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab42Q0PD08 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab42Q0PD08 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab42Q0PD08 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab42Q0PD08 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab42Q0PD08 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab42Q0PD08 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab42Q0PD08 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab42Q0PD08 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab42Q0PD08 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab42Q0PD08 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab42Q0PD08 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Rab42Q0PD08 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab42Q0PD08 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab42Q0PD08 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab42Q0PD08 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab42Q0PD08 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab42Q0PD08 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rab42Q0PD08 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab42Q0PD08 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab42Q0PD08 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rab42Q0PD08 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rab42Q0PD08 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rab42Q0PD08 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab42Q0PD08 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rab42Q0PD08 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab42Q0PD08 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab42Q0PD08 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rab42Q0PD08 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab42Q0PD08 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 253.5 ms