Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V9

Slc45a4, Solute carrier family 45 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a4Q0P5V9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc45a4Q0P5V9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc45a4Q0P5V9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc45a4Q0P5V9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc45a4Q0P5V9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc45a4Q0P5V9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc45a4Q0P5V9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc45a4Q0P5V9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc45a4Q0P5V9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc45a4Q0P5V9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc45a4Q0P5V9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc45a4Q0P5V9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc45a4Q0P5V9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc45a4Q0P5V9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc45a4Q0P5V9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc45a4Q0P5V9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc45a4Q0P5V9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc45a4Q0P5V9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc45a4Q0P5V9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc45a4Q0P5V9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc45a4Q0P5V9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc45a4Q0P5V9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc45a4Q0P5V9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc45a4Q0P5V9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc45a4Q0P5V9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc45a4Q0P5V9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc45a4Q0P5V9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc45a4Q0P5V9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc45a4Q0P5V9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc45a4Q0P5V9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc45a4Q0P5V9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc45a4Q0P5V9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc45a4Q0P5V9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc45a4Q0P5V9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc45a4Q0P5V9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc45a4Q0P5V9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc45a4Q0P5V9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc45a4Q0P5V9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc45a4Q0P5V9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc45a4Q0P5V9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc45a4Q0P5V9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc45a4Q0P5V9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc45a4Q0P5V9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc45a4Q0P5V9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc45a4Q0P5V9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc45a4Q0P5V9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc45a4Q0P5V9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc45a4Q0P5V9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc45a4Q0P5V9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc45a4Q0P5V9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc45a4Q0P5V9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc45a4Q0P5V9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc45a4Q0P5V9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc45a4Q0P5V9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc45a4Q0P5V9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc45a4Q0P5V9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc45a4Q0P5V9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc45a4Q0P5V9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc45a4Q0P5V9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc45a4Q0P5V9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc45a4Q0P5V9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc45a4Q0P5V9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc45a4Q0P5V9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc45a4Q0P5V9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc45a4Q0P5V9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc45a4Q0P5V9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc45a4Q0P5V9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc45a4Q0P5V9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc45a4Q0P5V9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Slc45a4Q0P5V9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Slc45a4Q0P5V9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc45a4Q0P5V9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc45a4Q0P5V9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc45a4Q0P5V9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc45a4Q0P5V9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc45a4Q0P5V9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc45a4Q0P5V9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc45a4Q0P5V9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Slc45a4Q0P5V9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc45a4Q0P5V9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc45a4Q0P5V9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc45a4Q0P5V9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc45a4Q0P5V9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc45a4Q0P5V9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc45a4Q0P5V9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc45a4Q0P5V9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc45a4Q0P5V9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc45a4Q0P5V9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc45a4Q0P5V9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc45a4Q0P5V9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc45a4Q0P5V9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc45a4Q0P5V9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc45a4Q0P5V9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc45a4Q0P5V9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc45a4Q0P5V9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc45a4Q0P5V9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc45a4Q0P5V9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc45a4Q0P5V9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc45a4Q0P5V9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc45a4Q0P5V9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms