Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cib3Q0P523 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cib3Q0P523 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cib3Q0P523 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cib3Q0P523 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cib3Q0P523 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cib3Q0P523 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cib3Q0P523 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cib3Q0P523 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cib3Q0P523 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cib3Q0P523 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cib3Q0P523 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cib3Q0P523 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cib3Q0P523 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cib3Q0P523 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cib3Q0P523 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cib3Q0P523 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cib3Q0P523 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cib3Q0P523 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cib3Q0P523 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cib3Q0P523 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cib3Q0P523 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cib3Q0P523 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cib3Q0P523 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cib3Q0P523 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cib3Q0P523 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cib3Q0P523 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cib3Q0P523 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cib3Q0P523 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cib3Q0P523 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cib3Q0P523 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cib3Q0P523 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cib3Q0P523 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cib3Q0P523 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cib3Q0P523 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cib3Q0P523 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cib3Q0P523 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cib3Q0P523 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cib3Q0P523 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cib3Q0P523 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cib3Q0P523 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cib3Q0P523 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cib3Q0P523 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cib3Q0P523 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cib3Q0P523 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cib3Q0P523 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cib3Q0P523 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cib3Q0P523 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cib3Q0P523 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Cib3Q0P523 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cib3Q0P523 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cib3Q0P523 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cib3Q0P523 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cib3Q0P523 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cib3Q0P523 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cib3Q0P523 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cib3Q0P523 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cib3Q0P523 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cib3Q0P523 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cib3Q0P523 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cib3Q0P523 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cib3Q0P523 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cib3Q0P523 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cib3Q0P523 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cib3Q0P523 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cib3Q0P523 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cib3Q0P523 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cib3Q0P523 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cib3Q0P523 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cib3Q0P523 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cib3Q0P523 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cib3Q0P523 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cib3Q0P523 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cib3Q0P523 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cib3Q0P523 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cib3Q0P523 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cib3Q0P523 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cib3Q0P523 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cib3Q0P523 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cib3Q0P523 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cib3Q0P523 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cib3Q0P523 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cib3Q0P523 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cib3Q0P523 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cib3Q0P523 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cib3Q0P523 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cib3Q0P523 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cib3Q0P523 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cib3Q0P523 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cib3Q0P523 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cib3Q0P523 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cib3Q0P523 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cib3Q0P523 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cib3Q0P523 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cib3Q0P523 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cib3Q0P523 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cib3Q0P523 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cib3Q0P523 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cib3Q0P523 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cib3Q0P523 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms