Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700061G19RikQ08EE8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700061G19RikQ08EE8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700061G19RikQ08EE8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700061G19RikQ08EE8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700061G19RikQ08EE8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700061G19RikQ08EE8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700061G19RikQ08EE8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
1700061G19RikQ08EE8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
1700061G19RikQ08EE8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
1700061G19RikQ08EE8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
1700061G19RikQ08EE8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
1700061G19RikQ08EE8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
1700061G19RikQ08EE8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
1700061G19RikQ08EE8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
1700061G19RikQ08EE8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
1700061G19RikQ08EE8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
1700061G19RikQ08EE8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
1700061G19RikQ08EE8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
1700061G19RikQ08EE8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
1700061G19RikQ08EE8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
1700061G19RikQ08EE8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
1700061G19RikQ08EE8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
1700061G19RikQ08EE8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
1700061G19RikQ08EE8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
1700061G19RikQ08EE8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
1700061G19RikQ08EE8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
1700061G19RikQ08EE8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
1700061G19RikQ08EE8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
1700061G19RikQ08EE8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
1700061G19RikQ08EE8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
1700061G19RikQ08EE8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
1700061G19RikQ08EE8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
1700061G19RikQ08EE8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700061G19RikQ08EE8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
1700061G19RikQ08EE8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
1700061G19RikQ08EE8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
1700061G19RikQ08EE8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
1700061G19RikQ08EE8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
1700061G19RikQ08EE8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
1700061G19RikQ08EE8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
1700061G19RikQ08EE8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
1700061G19RikQ08EE8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
1700061G19RikQ08EE8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
1700061G19RikQ08EE8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
1700061G19RikQ08EE8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
1700061G19RikQ08EE8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
1700061G19RikQ08EE8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
1700061G19RikQ08EE8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
1700061G19RikQ08EE8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
1700061G19RikQ08EE8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
1700061G19RikQ08EE8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
1700061G19RikQ08EE8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
1700061G19RikQ08EE8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
1700061G19RikQ08EE8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
1700061G19RikQ08EE8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
1700061G19RikQ08EE8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
1700061G19RikQ08EE8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
1700061G19RikQ08EE8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
1700061G19RikQ08EE8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
1700061G19RikQ08EE8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
1700061G19RikQ08EE8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
1700061G19RikQ08EE8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
1700061G19RikQ08EE8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
1700061G19RikQ08EE8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
1700061G19RikQ08EE8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
1700061G19RikQ08EE8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
1700061G19RikQ08EE8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
1700061G19RikQ08EE8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
1700061G19RikQ08EE8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
1700061G19RikQ08EE8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
1700061G19RikQ08EE8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
1700061G19RikQ08EE8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
1700061G19RikQ08EE8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
1700061G19RikQ08EE8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
1700061G19RikQ08EE8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
1700061G19RikQ08EE8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
1700061G19RikQ08EE8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700061G19RikQ08EE8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
1700061G19RikQ08EE8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700061G19RikQ08EE8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700061G19RikQ08EE8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700061G19RikQ08EE8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700061G19RikQ08EE8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
1700061G19RikQ08EE8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700061G19RikQ08EE8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700061G19RikQ08EE8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700061G19RikQ08EE8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700061G19RikQ08EE8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700061G19RikQ08EE8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
1700061G19RikQ08EE8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
1700061G19RikQ08EE8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700061G19RikQ08EE8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700061G19RikQ08EE8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700061G19RikQ08EE8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
1700061G19RikQ08EE8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700061G19RikQ08EE8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700061G19RikQ08EE8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms