Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI6

SLC38A11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A11Q08AI6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A11Q08AI6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A11Q08AI6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A11Q08AI6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A11Q08AI6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC38A11Q08AI6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC38A11Q08AI6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC38A11Q08AI6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC38A11Q08AI6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC38A11Q08AI6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC38A11Q08AI6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC38A11Q08AI6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC38A11Q08AI6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC38A11Q08AI6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC38A11Q08AI6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC38A11Q08AI6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC38A11Q08AI6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC38A11Q08AI6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC38A11Q08AI6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC38A11Q08AI6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC38A11Q08AI6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC38A11Q08AI6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A11Q08AI6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A11Q08AI6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A11Q08AI6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC38A11Q08AI6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC38A11Q08AI6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A11Q08AI6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A11Q08AI6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A11Q08AI6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC38A11Q08AI6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A11Q08AI6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A11Q08AI6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A11Q08AI6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A11Q08AI6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A11Q08AI6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A11Q08AI6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A11Q08AI6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC38A11Q08AI6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC38A11Q08AI6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC38A11Q08AI6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC38A11Q08AI6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC38A11Q08AI6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC38A11Q08AI6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC38A11Q08AI6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC38A11Q08AI6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC38A11Q08AI6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC38A11Q08AI6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC38A11Q08AI6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC38A11Q08AI6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC38A11Q08AI6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC38A11Q08AI6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC38A11Q08AI6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC38A11Q08AI6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC38A11Q08AI6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC38A11Q08AI6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC38A11Q08AI6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC38A11Q08AI6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC38A11Q08AI6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC38A11Q08AI6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC38A11Q08AI6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC38A11Q08AI6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC38A11Q08AI6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC38A11Q08AI6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC38A11Q08AI6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC38A11Q08AI6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC38A11Q08AI6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC38A11Q08AI6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC38A11Q08AI6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC38A11Q08AI6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A11Q08AI6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A11Q08AI6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A11Q08AI6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A11Q08AI6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC38A11Q08AI6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC38A11Q08AI6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC38A11Q08AI6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC38A11Q08AI6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC38A11Q08AI6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC38A11Q08AI6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC38A11Q08AI6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC38A11Q08AI6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC38A11Q08AI6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC38A11Q08AI6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC38A11Q08AI6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC38A11Q08AI6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC38A11Q08AI6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC38A11Q08AI6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC38A11Q08AI6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC38A11Q08AI6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC38A11Q08AI6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC38A11Q08AI6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC38A11Q08AI6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC38A11Q08AI6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC38A11Q08AI6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC38A11Q08AI6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLC38A11Q08AI6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLC38A11Q08AI6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC38A11Q08AI6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC38A11Q08AI6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms