Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH3

ACSM2A, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM2AQ08AH3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACSM2AQ08AH3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACSM2AQ08AH3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACSM2AQ08AH3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACSM2AQ08AH3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACSM2AQ08AH3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACSM2AQ08AH3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACSM2AQ08AH3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACSM2AQ08AH3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACSM2AQ08AH3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACSM2AQ08AH3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACSM2AQ08AH3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACSM2AQ08AH3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACSM2AQ08AH3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACSM2AQ08AH3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACSM2AQ08AH3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ACSM2AQ08AH3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACSM2AQ08AH3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACSM2AQ08AH3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ACSM2AQ08AH3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ACSM2AQ08AH3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACSM2AQ08AH3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACSM2AQ08AH3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACSM2AQ08AH3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACSM2AQ08AH3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACSM2AQ08AH3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACSM2AQ08AH3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACSM2AQ08AH3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACSM2AQ08AH3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACSM2AQ08AH3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACSM2AQ08AH3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACSM2AQ08AH3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACSM2AQ08AH3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACSM2AQ08AH3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACSM2AQ08AH3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACSM2AQ08AH3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACSM2AQ08AH3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACSM2AQ08AH3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACSM2AQ08AH3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACSM2AQ08AH3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACSM2AQ08AH3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACSM2AQ08AH3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACSM2AQ08AH3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACSM2AQ08AH3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACSM2AQ08AH3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACSM2AQ08AH3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACSM2AQ08AH3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACSM2AQ08AH3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACSM2AQ08AH3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACSM2AQ08AH3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACSM2AQ08AH3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACSM2AQ08AH3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACSM2AQ08AH3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACSM2AQ08AH3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACSM2AQ08AH3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACSM2AQ08AH3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACSM2AQ08AH3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACSM2AQ08AH3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACSM2AQ08AH3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACSM2AQ08AH3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ACSM2AQ08AH3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACSM2AQ08AH3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACSM2AQ08AH3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACSM2AQ08AH3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACSM2AQ08AH3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACSM2AQ08AH3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACSM2AQ08AH3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACSM2AQ08AH3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACSM2AQ08AH3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACSM2AQ08AH3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACSM2AQ08AH3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACSM2AQ08AH3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACSM2AQ08AH3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACSM2AQ08AH3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACSM2AQ08AH3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACSM2AQ08AH3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACSM2AQ08AH3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACSM2AQ08AH3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ACSM2AQ08AH3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ACSM2AQ08AH3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACSM2AQ08AH3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACSM2AQ08AH3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACSM2AQ08AH3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACSM2AQ08AH3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACSM2AQ08AH3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACSM2AQ08AH3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACSM2AQ08AH3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ACSM2AQ08AH3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACSM2AQ08AH3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ACSM2AQ08AH3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACSM2AQ08AH3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACSM2AQ08AH3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACSM2AQ08AH3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACSM2AQ08AH3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSM2AQ08AH3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSM2AQ08AH3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSM2AQ08AH3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSM2AQ08AH3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSM2AQ08AH3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACSM2AQ08AH3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms