Protein–RNA interactions for Protein: Q08999

RBL2, Retinoblastoma-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL2Q08999 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RBL2Q08999 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RBL2Q08999 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
RBL2Q08999 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RBL2Q08999 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RBL2Q08999 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RBL2Q08999 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RBL2Q08999 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RBL2Q08999 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RBL2Q08999 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RBL2Q08999 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RBL2Q08999 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RBL2Q08999 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RBL2Q08999 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RBL2Q08999 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RBL2Q08999 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RBL2Q08999 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RBL2Q08999 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RBL2Q08999 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RBL2Q08999 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RBL2Q08999 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RBL2Q08999 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RBL2Q08999 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RBL2Q08999 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RBL2Q08999 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RBL2Q08999 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RBL2Q08999 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RBL2Q08999 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RBL2Q08999 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RBL2Q08999 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
RBL2Q08999 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RBL2Q08999 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RBL2Q08999 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RBL2Q08999 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
RBL2Q08999 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
RBL2Q08999 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RBL2Q08999 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RBL2Q08999 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RBL2Q08999 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RBL2Q08999 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RBL2Q08999 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RBL2Q08999 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RBL2Q08999 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
RBL2Q08999 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RBL2Q08999 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RBL2Q08999 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RBL2Q08999 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RBL2Q08999 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RBL2Q08999 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RBL2Q08999 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RBL2Q08999 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RBL2Q08999 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RBL2Q08999 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
RBL2Q08999 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
RBL2Q08999 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RBL2Q08999 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RBL2Q08999 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RBL2Q08999 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RBL2Q08999 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RBL2Q08999 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RBL2Q08999 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RBL2Q08999 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RBL2Q08999 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RBL2Q08999 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RBL2Q08999 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RBL2Q08999 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RBL2Q08999 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RBL2Q08999 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RBL2Q08999 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RBL2Q08999 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RBL2Q08999 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RBL2Q08999 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RBL2Q08999 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RBL2Q08999 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RBL2Q08999 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RBL2Q08999 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RBL2Q08999 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RBL2Q08999 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RBL2Q08999 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RBL2Q08999 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RBL2Q08999 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RBL2Q08999 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RBL2Q08999 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RBL2Q08999 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RBL2Q08999 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RBL2Q08999 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RBL2Q08999 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RBL2Q08999 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RBL2Q08999 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RBL2Q08999 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RBL2Q08999 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RBL2Q08999 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
RBL2Q08999 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RBL2Q08999 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RBL2Q08999 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RBL2Q08999 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
RBL2Q08999 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RBL2Q08999 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RBL2Q08999 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RBL2Q08999 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms