Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD47Q08722 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD47Q08722 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD47Q08722 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD47Q08722 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD47Q08722 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD47Q08722 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD47Q08722 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD47Q08722 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD47Q08722 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD47Q08722 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD47Q08722 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD47Q08722 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD47Q08722 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD47Q08722 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD47Q08722 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD47Q08722 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CD47Q08722 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD47Q08722 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD47Q08722 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD47Q08722 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CD47Q08722 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD47Q08722 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD47Q08722 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD47Q08722 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD47Q08722 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD47Q08722 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD47Q08722 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD47Q08722 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD47Q08722 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD47Q08722 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD47Q08722 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD47Q08722 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD47Q08722 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD47Q08722 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD47Q08722 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD47Q08722 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD47Q08722 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD47Q08722 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD47Q08722 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD47Q08722 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD47Q08722 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD47Q08722 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD47Q08722 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD47Q08722 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD47Q08722 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD47Q08722 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD47Q08722 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD47Q08722 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD47Q08722 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD47Q08722 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD47Q08722 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD47Q08722 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD47Q08722 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD47Q08722 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD47Q08722 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD47Q08722 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD47Q08722 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD47Q08722 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD47Q08722 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD47Q08722 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD47Q08722 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD47Q08722 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD47Q08722 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD47Q08722 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD47Q08722 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD47Q08722 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD47Q08722 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD47Q08722 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD47Q08722 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD47Q08722 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD47Q08722 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD47Q08722 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD47Q08722 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD47Q08722 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD47Q08722 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD47Q08722 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD47Q08722 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD47Q08722 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD47Q08722 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD47Q08722 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD47Q08722 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD47Q08722 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD47Q08722 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD47Q08722 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD47Q08722 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD47Q08722 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD47Q08722 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD47Q08722 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD47Q08722 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD47Q08722 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD47Q08722 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CD47Q08722 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD47Q08722 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD47Q08722 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD47Q08722 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD47Q08722 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD47Q08722 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD47Q08722 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD47Q08722 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms