Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD300CQ08708 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD300CQ08708 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD300CQ08708 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD300CQ08708 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD300CQ08708 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD300CQ08708 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD300CQ08708 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD300CQ08708 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD300CQ08708 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD300CQ08708 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD300CQ08708 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD300CQ08708 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CD300CQ08708 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD300CQ08708 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD300CQ08708 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD300CQ08708 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD300CQ08708 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD300CQ08708 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD300CQ08708 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD300CQ08708 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CD300CQ08708 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD300CQ08708 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD300CQ08708 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD300CQ08708 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD300CQ08708 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD300CQ08708 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD300CQ08708 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD300CQ08708 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD300CQ08708 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD300CQ08708 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD300CQ08708 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD300CQ08708 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD300CQ08708 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD300CQ08708 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD300CQ08708 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CD300CQ08708 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD300CQ08708 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD300CQ08708 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD300CQ08708 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD300CQ08708 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD300CQ08708 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD300CQ08708 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD300CQ08708 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD300CQ08708 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD300CQ08708 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD300CQ08708 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD300CQ08708 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD300CQ08708 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD300CQ08708 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD300CQ08708 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD300CQ08708 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD300CQ08708 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD300CQ08708 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD300CQ08708 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD300CQ08708 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD300CQ08708 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CD300CQ08708 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD300CQ08708 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD300CQ08708 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD300CQ08708 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD300CQ08708 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD300CQ08708 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD300CQ08708 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD300CQ08708 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD300CQ08708 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD300CQ08708 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD300CQ08708 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD300CQ08708 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD300CQ08708 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD300CQ08708 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD300CQ08708 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD300CQ08708 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD300CQ08708 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD300CQ08708 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD300CQ08708 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD300CQ08708 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD300CQ08708 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD300CQ08708 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD300CQ08708 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD300CQ08708 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD300CQ08708 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD300CQ08708 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD300CQ08708 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD300CQ08708 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD300CQ08708 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD300CQ08708 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD300CQ08708 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD300CQ08708 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD300CQ08708 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CD300CQ08708 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CD300CQ08708 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD300CQ08708 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD300CQ08708 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD300CQ08708 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD300CQ08708 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD300CQ08708 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD300CQ08708 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD300CQ08708 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD300CQ08708 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms