Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbp2Q08652 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbp2Q08652 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbp2Q08652 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbp2Q08652 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbp2Q08652 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbp2Q08652 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbp2Q08652 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbp2Q08652 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbp2Q08652 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbp2Q08652 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbp2Q08652 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbp2Q08652 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbp2Q08652 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbp2Q08652 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbp2Q08652 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbp2Q08652 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbp2Q08652 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbp2Q08652 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbp2Q08652 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbp2Q08652 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbp2Q08652 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbp2Q08652 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbp2Q08652 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbp2Q08652 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbp2Q08652 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbp2Q08652 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbp2Q08652 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbp2Q08652 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbp2Q08652 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbp2Q08652 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbp2Q08652 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbp2Q08652 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbp2Q08652 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbp2Q08652 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbp2Q08652 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbp2Q08652 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbp2Q08652 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbp2Q08652 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbp2Q08652 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbp2Q08652 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbp2Q08652 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbp2Q08652 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbp2Q08652 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbp2Q08652 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbp2Q08652 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbp2Q08652 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbp2Q08652 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rbp2Q08652 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rbp2Q08652 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rbp2Q08652 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rbp2Q08652 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rbp2Q08652 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rbp2Q08652 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbp2Q08652 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbp2Q08652 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbp2Q08652 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbp2Q08652 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbp2Q08652 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbp2Q08652 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbp2Q08652 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rbp2Q08652 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rbp2Q08652 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rbp2Q08652 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rbp2Q08652 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rbp2Q08652 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rbp2Q08652 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rbp2Q08652 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rbp2Q08652 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rbp2Q08652 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbp2Q08652 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbp2Q08652 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbp2Q08652 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbp2Q08652 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbp2Q08652 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbp2Q08652 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbp2Q08652 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbp2Q08652 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbp2Q08652 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbp2Q08652 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp2Q08652 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp2Q08652 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp2Q08652 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbp2Q08652 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbp2Q08652 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rbp2Q08652 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rbp2Q08652 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbp2Q08652 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbp2Q08652 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbp2Q08652 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbp2Q08652 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbp2Q08652 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbp2Q08652 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbp2Q08652 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbp2Q08652 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbp2Q08652 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbp2Q08652 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbp2Q08652 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbp2Q08652 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbp2Q08652 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms