Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP4F3Q08477 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP4F3Q08477 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP4F3Q08477 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP4F3Q08477 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYP4F3Q08477 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP4F3Q08477 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP4F3Q08477 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP4F3Q08477 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP4F3Q08477 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYP4F3Q08477 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYP4F3Q08477 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYP4F3Q08477 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYP4F3Q08477 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYP4F3Q08477 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYP4F3Q08477 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP4F3Q08477 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP4F3Q08477 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYP4F3Q08477 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYP4F3Q08477 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYP4F3Q08477 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYP4F3Q08477 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYP4F3Q08477 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYP4F3Q08477 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYP4F3Q08477 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYP4F3Q08477 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CYP4F3Q08477 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYP4F3Q08477 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYP4F3Q08477 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYP4F3Q08477 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYP4F3Q08477 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP4F3Q08477 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP4F3Q08477 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP4F3Q08477 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP4F3Q08477 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP4F3Q08477 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP4F3Q08477 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP4F3Q08477 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP4F3Q08477 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP4F3Q08477 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP4F3Q08477 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYP4F3Q08477 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYP4F3Q08477 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYP4F3Q08477 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYP4F3Q08477 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYP4F3Q08477 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYP4F3Q08477 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYP4F3Q08477 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYP4F3Q08477 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYP4F3Q08477 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYP4F3Q08477 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CYP4F3Q08477 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYP4F3Q08477 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYP4F3Q08477 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYP4F3Q08477 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYP4F3Q08477 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYP4F3Q08477 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CYP4F3Q08477 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CYP4F3Q08477 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CYP4F3Q08477 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYP4F3Q08477 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYP4F3Q08477 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYP4F3Q08477 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYP4F3Q08477 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYP4F3Q08477 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYP4F3Q08477 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYP4F3Q08477 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYP4F3Q08477 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYP4F3Q08477 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYP4F3Q08477 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYP4F3Q08477 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYP4F3Q08477 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYP4F3Q08477 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYP4F3Q08477 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYP4F3Q08477 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYP4F3Q08477 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYP4F3Q08477 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYP4F3Q08477 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYP4F3Q08477 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYP4F3Q08477 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYP4F3Q08477 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYP4F3Q08477 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYP4F3Q08477 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CYP4F3Q08477 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYP4F3Q08477 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYP4F3Q08477 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYP4F3Q08477 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYP4F3Q08477 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYP4F3Q08477 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYP4F3Q08477 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CYP4F3Q08477 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYP4F3Q08477 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYP4F3Q08477 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYP4F3Q08477 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYP4F3Q08477 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYP4F3Q08477 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYP4F3Q08477 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP4F3Q08477 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP4F3Q08477 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP4F3Q08477 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms