Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdx4Q07424 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdx4Q07424 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdx4Q07424 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdx4Q07424 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdx4Q07424 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdx4Q07424 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdx4Q07424 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdx4Q07424 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdx4Q07424 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdx4Q07424 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdx4Q07424 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdx4Q07424 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdx4Q07424 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdx4Q07424 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdx4Q07424 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdx4Q07424 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdx4Q07424 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdx4Q07424 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdx4Q07424 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdx4Q07424 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdx4Q07424 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdx4Q07424 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdx4Q07424 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdx4Q07424 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdx4Q07424 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdx4Q07424 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdx4Q07424 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdx4Q07424 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdx4Q07424 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdx4Q07424 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdx4Q07424 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdx4Q07424 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdx4Q07424 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdx4Q07424 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdx4Q07424 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdx4Q07424 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdx4Q07424 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdx4Q07424 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdx4Q07424 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdx4Q07424 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdx4Q07424 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdx4Q07424 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdx4Q07424 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdx4Q07424 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdx4Q07424 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdx4Q07424 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdx4Q07424 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdx4Q07424 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdx4Q07424 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdx4Q07424 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdx4Q07424 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cdx4Q07424 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdx4Q07424 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdx4Q07424 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdx4Q07424 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdx4Q07424 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdx4Q07424 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdx4Q07424 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdx4Q07424 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdx4Q07424 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdx4Q07424 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdx4Q07424 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdx4Q07424 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdx4Q07424 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdx4Q07424 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdx4Q07424 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdx4Q07424 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdx4Q07424 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdx4Q07424 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdx4Q07424 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdx4Q07424 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdx4Q07424 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdx4Q07424 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdx4Q07424 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdx4Q07424 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdx4Q07424 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdx4Q07424 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdx4Q07424 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdx4Q07424 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdx4Q07424 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdx4Q07424 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdx4Q07424 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdx4Q07424 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdx4Q07424 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdx4Q07424 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdx4Q07424 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdx4Q07424 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdx4Q07424 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdx4Q07424 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdx4Q07424 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdx4Q07424 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdx4Q07424 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdx4Q07424 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdx4Q07424 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdx4Q07424 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdx4Q07424 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdx4Q07424 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdx4Q07424 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdx4Q07424 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms