Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cntn3Q07409 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cntn3Q07409 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cntn3Q07409 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cntn3Q07409 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cntn3Q07409 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cntn3Q07409 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cntn3Q07409 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cntn3Q07409 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cntn3Q07409 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Cntn3Q07409 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cntn3Q07409 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cntn3Q07409 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cntn3Q07409 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cntn3Q07409 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Cntn3Q07409 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Cntn3Q07409 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cntn3Q07409 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cntn3Q07409 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cntn3Q07409 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cntn3Q07409 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cntn3Q07409 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cntn3Q07409 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cntn3Q07409 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cntn3Q07409 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cntn3Q07409 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cntn3Q07409 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cntn3Q07409 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cntn3Q07409 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cntn3Q07409 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cntn3Q07409 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cntn3Q07409 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cntn3Q07409 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cntn3Q07409 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cntn3Q07409 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cntn3Q07409 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cntn3Q07409 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cntn3Q07409 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cntn3Q07409 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cntn3Q07409 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cntn3Q07409 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Cntn3Q07409 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Cntn3Q07409 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cntn3Q07409 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cntn3Q07409 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cntn3Q07409 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cntn3Q07409 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cntn3Q07409 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cntn3Q07409 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cntn3Q07409 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cntn3Q07409 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cntn3Q07409 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cntn3Q07409 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cntn3Q07409 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cntn3Q07409 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cntn3Q07409 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cntn3Q07409 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cntn3Q07409 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cntn3Q07409 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cntn3Q07409 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cntn3Q07409 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cntn3Q07409 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cntn3Q07409 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cntn3Q07409 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cntn3Q07409 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cntn3Q07409 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cntn3Q07409 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cntn3Q07409 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cntn3Q07409 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cntn3Q07409 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cntn3Q07409 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cntn3Q07409 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cntn3Q07409 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cntn3Q07409 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cntn3Q07409 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cntn3Q07409 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cntn3Q07409 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cntn3Q07409 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cntn3Q07409 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cntn3Q07409 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cntn3Q07409 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cntn3Q07409 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cntn3Q07409 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cntn3Q07409 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cntn3Q07409 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cntn3Q07409 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cntn3Q07409 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cntn3Q07409 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cntn3Q07409 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cntn3Q07409 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cntn3Q07409 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cntn3Q07409 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cntn3Q07409 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cntn3Q07409 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cntn3Q07409 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cntn3Q07409 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cntn3Q07409 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cntn3Q07409 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cntn3Q07409 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cntn3Q07409 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms