Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK18Q07002 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK18Q07002 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK18Q07002 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK18Q07002 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK18Q07002 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK18Q07002 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK18Q07002 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK18Q07002 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK18Q07002 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK18Q07002 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK18Q07002 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK18Q07002 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK18Q07002 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK18Q07002 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK18Q07002 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK18Q07002 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK18Q07002 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK18Q07002 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK18Q07002 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK18Q07002 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK18Q07002 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK18Q07002 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK18Q07002 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK18Q07002 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK18Q07002 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK18Q07002 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK18Q07002 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK18Q07002 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK18Q07002 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK18Q07002 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDK18Q07002 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK18Q07002 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK18Q07002 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDK18Q07002 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK18Q07002 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK18Q07002 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK18Q07002 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK18Q07002 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK18Q07002 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK18Q07002 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK18Q07002 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK18Q07002 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK18Q07002 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDK18Q07002 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK18Q07002 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK18Q07002 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK18Q07002 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK18Q07002 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK18Q07002 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK18Q07002 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK18Q07002 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK18Q07002 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK18Q07002 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK18Q07002 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK18Q07002 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK18Q07002 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK18Q07002 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK18Q07002 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK18Q07002 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK18Q07002 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK18Q07002 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK18Q07002 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK18Q07002 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDK18Q07002 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDK18Q07002 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK18Q07002 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK18Q07002 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK18Q07002 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK18Q07002 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK18Q07002 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK18Q07002 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK18Q07002 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK18Q07002 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK18Q07002 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK18Q07002 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK18Q07002 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK18Q07002 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK18Q07002 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK18Q07002 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK18Q07002 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK18Q07002 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK18Q07002 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK18Q07002 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK18Q07002 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK18Q07002 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK18Q07002 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK18Q07002 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK18Q07002 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK18Q07002 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK18Q07002 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK18Q07002 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK18Q07002 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK18Q07002 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK18Q07002 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK18Q07002 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK18Q07002 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK18Q07002 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK18Q07002 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK18Q07002 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms