Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FMODQ06828 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FMODQ06828 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FMODQ06828 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FMODQ06828 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FMODQ06828 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FMODQ06828 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FMODQ06828 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FMODQ06828 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FMODQ06828 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FMODQ06828 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FMODQ06828 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FMODQ06828 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FMODQ06828 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FMODQ06828 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FMODQ06828 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FMODQ06828 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FMODQ06828 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FMODQ06828 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FMODQ06828 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FMODQ06828 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FMODQ06828 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FMODQ06828 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FMODQ06828 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FMODQ06828 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FMODQ06828 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FMODQ06828 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FMODQ06828 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FMODQ06828 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FMODQ06828 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FMODQ06828 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FMODQ06828 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FMODQ06828 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FMODQ06828 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FMODQ06828 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FMODQ06828 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FMODQ06828 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FMODQ06828 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FMODQ06828 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FMODQ06828 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FMODQ06828 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FMODQ06828 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FMODQ06828 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FMODQ06828 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FMODQ06828 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FMODQ06828 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FMODQ06828 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FMODQ06828 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FMODQ06828 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FMODQ06828 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FMODQ06828 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FMODQ06828 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FMODQ06828 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FMODQ06828 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FMODQ06828 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FMODQ06828 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FMODQ06828 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FMODQ06828 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FMODQ06828 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FMODQ06828 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FMODQ06828 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FMODQ06828 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FMODQ06828 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FMODQ06828 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FMODQ06828 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FMODQ06828 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FMODQ06828 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FMODQ06828 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FMODQ06828 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FMODQ06828 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FMODQ06828 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FMODQ06828 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FMODQ06828 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FMODQ06828 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FMODQ06828 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FMODQ06828 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FMODQ06828 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FMODQ06828 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FMODQ06828 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FMODQ06828 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FMODQ06828 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FMODQ06828 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FMODQ06828 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FMODQ06828 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FMODQ06828 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FMODQ06828 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FMODQ06828 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FMODQ06828 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FMODQ06828 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FMODQ06828 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FMODQ06828 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FMODQ06828 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FMODQ06828 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FMODQ06828 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FMODQ06828 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FMODQ06828 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FMODQ06828 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FMODQ06828 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FMODQ06828 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FMODQ06828 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms