Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNX1T1Q06455 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUNX1T1Q06455 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUNX1T1Q06455 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNX1T1Q06455 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNX1T1Q06455 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNX1T1Q06455 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNX1T1Q06455 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNX1T1Q06455 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNX1T1Q06455 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNX1T1Q06455 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNX1T1Q06455 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNX1T1Q06455 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNX1T1Q06455 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNX1T1Q06455 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNX1T1Q06455 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNX1T1Q06455 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNX1T1Q06455 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNX1T1Q06455 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNX1T1Q06455 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNX1T1Q06455 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNX1T1Q06455 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUNX1T1Q06455 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUNX1T1Q06455 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNX1T1Q06455 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNX1T1Q06455 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNX1T1Q06455 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNX1T1Q06455 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNX1T1Q06455 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNX1T1Q06455 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNX1T1Q06455 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNX1T1Q06455 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNX1T1Q06455 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNX1T1Q06455 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNX1T1Q06455 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNX1T1Q06455 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNX1T1Q06455 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNX1T1Q06455 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNX1T1Q06455 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNX1T1Q06455 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNX1T1Q06455 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNX1T1Q06455 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNX1T1Q06455 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNX1T1Q06455 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNX1T1Q06455 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNX1T1Q06455 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNX1T1Q06455 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNX1T1Q06455 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNX1T1Q06455 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNX1T1Q06455 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNX1T1Q06455 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNX1T1Q06455 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNX1T1Q06455 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUNX1T1Q06455 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RUNX1T1Q06455 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUNX1T1Q06455 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUNX1T1Q06455 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUNX1T1Q06455 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNX1T1Q06455 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNX1T1Q06455 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNX1T1Q06455 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNX1T1Q06455 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNX1T1Q06455 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNX1T1Q06455 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNX1T1Q06455 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNX1T1Q06455 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNX1T1Q06455 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNX1T1Q06455 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNX1T1Q06455 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNX1T1Q06455 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNX1T1Q06455 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNX1T1Q06455 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RUNX1T1Q06455 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RUNX1T1Q06455 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RUNX1T1Q06455 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNX1T1Q06455 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNX1T1Q06455 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNX1T1Q06455 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNX1T1Q06455 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNX1T1Q06455 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNX1T1Q06455 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNX1T1Q06455 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNX1T1Q06455 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNX1T1Q06455 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNX1T1Q06455 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNX1T1Q06455 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNX1T1Q06455 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNX1T1Q06455 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNX1T1Q06455 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RUNX1T1Q06455 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUNX1T1Q06455 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUNX1T1Q06455 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNX1T1Q06455 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNX1T1Q06455 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNX1T1Q06455 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNX1T1Q06455 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNX1T1Q06455 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNX1T1Q06455 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNX1T1Q06455 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNX1T1Q06455 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms