Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DEUP1Q05D60 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DEUP1Q05D60 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DEUP1Q05D60 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DEUP1Q05D60 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DEUP1Q05D60 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DEUP1Q05D60 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DEUP1Q05D60 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DEUP1Q05D60 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DEUP1Q05D60 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DEUP1Q05D60 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DEUP1Q05D60 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DEUP1Q05D60 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DEUP1Q05D60 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DEUP1Q05D60 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DEUP1Q05D60 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DEUP1Q05D60 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DEUP1Q05D60 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DEUP1Q05D60 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DEUP1Q05D60 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DEUP1Q05D60 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
DEUP1Q05D60 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DEUP1Q05D60 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DEUP1Q05D60 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DEUP1Q05D60 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
DEUP1Q05D60 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DEUP1Q05D60 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DEUP1Q05D60 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DEUP1Q05D60 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DEUP1Q05D60 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DEUP1Q05D60 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DEUP1Q05D60 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DEUP1Q05D60 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DEUP1Q05D60 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DEUP1Q05D60 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DEUP1Q05D60 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DEUP1Q05D60 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DEUP1Q05D60 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DEUP1Q05D60 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DEUP1Q05D60 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DEUP1Q05D60 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DEUP1Q05D60 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DEUP1Q05D60 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DEUP1Q05D60 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DEUP1Q05D60 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DEUP1Q05D60 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
DEUP1Q05D60 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DEUP1Q05D60 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DEUP1Q05D60 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DEUP1Q05D60 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DEUP1Q05D60 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DEUP1Q05D60 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DEUP1Q05D60 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DEUP1Q05D60 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DEUP1Q05D60 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DEUP1Q05D60 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DEUP1Q05D60 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DEUP1Q05D60 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DEUP1Q05D60 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
DEUP1Q05D60 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DEUP1Q05D60 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DEUP1Q05D60 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DEUP1Q05D60 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DEUP1Q05D60 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
DEUP1Q05D60 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DEUP1Q05D60 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DEUP1Q05D60 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DEUP1Q05D60 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
DEUP1Q05D60 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DEUP1Q05D60 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
DEUP1Q05D60 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.57■■■□□ 2
DEUP1Q05D60 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DEUP1Q05D60 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DEUP1Q05D60 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.54■■■□□ 2
DEUP1Q05D60 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
DEUP1Q05D60 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
DEUP1Q05D60 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
DEUP1Q05D60 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DEUP1Q05D60 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DEUP1Q05D60 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DEUP1Q05D60 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DEUP1Q05D60 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DEUP1Q05D60 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DEUP1Q05D60 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DEUP1Q05D60 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
DEUP1Q05D60 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DEUP1Q05D60 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DEUP1Q05D60 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
DEUP1Q05D60 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DEUP1Q05D60 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
DEUP1Q05D60 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DEUP1Q05D60 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DEUP1Q05D60 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DEUP1Q05D60 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DEUP1Q05D60 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DEUP1Q05D60 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DEUP1Q05D60 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DEUP1Q05D60 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DEUP1Q05D60 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DEUP1Q05D60 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms