Protein–RNA interactions for Protein: Q05915

Gch1, GTP cyclohydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gch1Q05915 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gch1Q05915 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gch1Q05915 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gch1Q05915 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gch1Q05915 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gch1Q05915 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gch1Q05915 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gch1Q05915 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gch1Q05915 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gch1Q05915 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gch1Q05915 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gch1Q05915 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gch1Q05915 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gch1Q05915 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gch1Q05915 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gch1Q05915 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gch1Q05915 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gch1Q05915 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gch1Q05915 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gch1Q05915 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gch1Q05915 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gch1Q05915 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gch1Q05915 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gch1Q05915 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gch1Q05915 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gch1Q05915 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gch1Q05915 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gch1Q05915 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gch1Q05915 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gch1Q05915 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gch1Q05915 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gch1Q05915 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gch1Q05915 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gch1Q05915 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gch1Q05915 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gch1Q05915 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gch1Q05915 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gch1Q05915 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gch1Q05915 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gch1Q05915 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gch1Q05915 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gch1Q05915 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gch1Q05915 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gch1Q05915 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gch1Q05915 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gch1Q05915 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gch1Q05915 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gch1Q05915 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gch1Q05915 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gch1Q05915 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gch1Q05915 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gch1Q05915 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gch1Q05915 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gch1Q05915 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gch1Q05915 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gch1Q05915 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gch1Q05915 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gch1Q05915 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gch1Q05915 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gch1Q05915 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gch1Q05915 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gch1Q05915 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gch1Q05915 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gch1Q05915 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gch1Q05915 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gch1Q05915 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gch1Q05915 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gch1Q05915 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gch1Q05915 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gch1Q05915 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gch1Q05915 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gch1Q05915 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gch1Q05915 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gch1Q05915 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gch1Q05915 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gch1Q05915 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gch1Q05915 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gch1Q05915 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gch1Q05915 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gch1Q05915 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gch1Q05915 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gch1Q05915 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gch1Q05915 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gch1Q05915 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gch1Q05915 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gch1Q05915 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gch1Q05915 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gch1Q05915 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gch1Q05915 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gch1Q05915 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gch1Q05915 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gch1Q05915 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gch1Q05915 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gch1Q05915 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gch1Q05915 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gch1Q05915 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gch1Q05915 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gch1Q05915 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gch1Q05915 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gch1Q05915 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 493.1 ms