Protein–RNA interactions for Protein: Q04864

REL, Proto-oncogene c-Rel, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELQ04864 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RELQ04864 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RELQ04864 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RELQ04864 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RELQ04864 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RELQ04864 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RELQ04864 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RELQ04864 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RELQ04864 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RELQ04864 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RELQ04864 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RELQ04864 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RELQ04864 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RELQ04864 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RELQ04864 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RELQ04864 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RELQ04864 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RELQ04864 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RELQ04864 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RELQ04864 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RELQ04864 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RELQ04864 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RELQ04864 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RELQ04864 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RELQ04864 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RELQ04864 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RELQ04864 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RELQ04864 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RELQ04864 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RELQ04864 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RELQ04864 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RELQ04864 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RELQ04864 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RELQ04864 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RELQ04864 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RELQ04864 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RELQ04864 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RELQ04864 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RELQ04864 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RELQ04864 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RELQ04864 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RELQ04864 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RELQ04864 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RELQ04864 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RELQ04864 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RELQ04864 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RELQ04864 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RELQ04864 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RELQ04864 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RELQ04864 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RELQ04864 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RELQ04864 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RELQ04864 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RELQ04864 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RELQ04864 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RELQ04864 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RELQ04864 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RELQ04864 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RELQ04864 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RELQ04864 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RELQ04864 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RELQ04864 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RELQ04864 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RELQ04864 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RELQ04864 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RELQ04864 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RELQ04864 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RELQ04864 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RELQ04864 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RELQ04864 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RELQ04864 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RELQ04864 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RELQ04864 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RELQ04864 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RELQ04864 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RELQ04864 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RELQ04864 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RELQ04864 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RELQ04864 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RELQ04864 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RELQ04864 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RELQ04864 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RELQ04864 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RELQ04864 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RELQ04864 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RELQ04864 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RELQ04864 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RELQ04864 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RELQ04864 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RELQ04864 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RELQ04864 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RELQ04864 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RELQ04864 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RELQ04864 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RELQ04864 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RELQ04864 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RELQ04864 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RELQ04864 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RELQ04864 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RELQ04864 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms