Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNEQ04844 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNEQ04844 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNEQ04844 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNEQ04844 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNEQ04844 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNEQ04844 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNEQ04844 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNEQ04844 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNEQ04844 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNEQ04844 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNEQ04844 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNEQ04844 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNEQ04844 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNEQ04844 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNEQ04844 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNEQ04844 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNEQ04844 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNEQ04844 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNEQ04844 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNEQ04844 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNEQ04844 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNEQ04844 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNEQ04844 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNEQ04844 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNEQ04844 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNEQ04844 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNEQ04844 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNEQ04844 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNEQ04844 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNEQ04844 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNEQ04844 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNEQ04844 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNEQ04844 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNEQ04844 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNEQ04844 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNEQ04844 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNEQ04844 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNEQ04844 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNEQ04844 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNEQ04844 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNEQ04844 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNEQ04844 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNEQ04844 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNEQ04844 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNEQ04844 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNEQ04844 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNEQ04844 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNEQ04844 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNEQ04844 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNEQ04844 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNEQ04844 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHRNEQ04844 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNEQ04844 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNEQ04844 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNEQ04844 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNEQ04844 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNEQ04844 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNEQ04844 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNEQ04844 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNEQ04844 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNEQ04844 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNEQ04844 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNEQ04844 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNEQ04844 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNEQ04844 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNEQ04844 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNEQ04844 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNEQ04844 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNEQ04844 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNEQ04844 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNEQ04844 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNEQ04844 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNEQ04844 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNEQ04844 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNEQ04844 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNEQ04844 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNEQ04844 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNEQ04844 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNEQ04844 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNEQ04844 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNEQ04844 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNEQ04844 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNEQ04844 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNEQ04844 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNEQ04844 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNEQ04844 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNEQ04844 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHRNEQ04844 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNEQ04844 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNEQ04844 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNEQ04844 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNEQ04844 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNEQ04844 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNEQ04844 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNEQ04844 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNEQ04844 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNEQ04844 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNEQ04844 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNEQ04844 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms