Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACVR1Q04771 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACVR1Q04771 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACVR1Q04771 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACVR1Q04771 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACVR1Q04771 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACVR1Q04771 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACVR1Q04771 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ACVR1Q04771 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ACVR1Q04771 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ACVR1Q04771 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ACVR1Q04771 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ACVR1Q04771 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ACVR1Q04771 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ACVR1Q04771 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACVR1Q04771 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACVR1Q04771 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACVR1Q04771 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACVR1Q04771 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACVR1Q04771 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACVR1Q04771 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACVR1Q04771 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACVR1Q04771 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACVR1Q04771 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACVR1Q04771 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACVR1Q04771 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACVR1Q04771 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACVR1Q04771 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACVR1Q04771 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACVR1Q04771 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACVR1Q04771 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ACVR1Q04771 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACVR1Q04771 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACVR1Q04771 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACVR1Q04771 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACVR1Q04771 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACVR1Q04771 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACVR1Q04771 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACVR1Q04771 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACVR1Q04771 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACVR1Q04771 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACVR1Q04771 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACVR1Q04771 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACVR1Q04771 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACVR1Q04771 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACVR1Q04771 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACVR1Q04771 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACVR1Q04771 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACVR1Q04771 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACVR1Q04771 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACVR1Q04771 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACVR1Q04771 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACVR1Q04771 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACVR1Q04771 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACVR1Q04771 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACVR1Q04771 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACVR1Q04771 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACVR1Q04771 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACVR1Q04771 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ACVR1Q04771 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ACVR1Q04771 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACVR1Q04771 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACVR1Q04771 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACVR1Q04771 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACVR1Q04771 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACVR1Q04771 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ACVR1Q04771 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACVR1Q04771 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACVR1Q04771 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACVR1Q04771 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACVR1Q04771 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACVR1Q04771 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACVR1Q04771 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACVR1Q04771 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACVR1Q04771 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACVR1Q04771 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACVR1Q04771 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACVR1Q04771 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACVR1Q04771 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ACVR1Q04771 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACVR1Q04771 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACVR1Q04771 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACVR1Q04771 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ACVR1Q04771 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACVR1Q04771 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ACVR1Q04771 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACVR1Q04771 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACVR1Q04771 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACVR1Q04771 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACVR1Q04771 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACVR1Q04771 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACVR1Q04771 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACVR1Q04771 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACVR1Q04771 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACVR1Q04771 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACVR1Q04771 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACVR1Q04771 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACVR1Q04771 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACVR1Q04771 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACVR1Q04771 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms