Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk16Q04735 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk16Q04735 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk16Q04735 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk16Q04735 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk16Q04735 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk16Q04735 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk16Q04735 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk16Q04735 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk16Q04735 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk16Q04735 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk16Q04735 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk16Q04735 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk16Q04735 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdk16Q04735 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdk16Q04735 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdk16Q04735 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdk16Q04735 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdk16Q04735 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk16Q04735 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk16Q04735 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk16Q04735 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk16Q04735 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk16Q04735 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk16Q04735 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk16Q04735 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk16Q04735 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk16Q04735 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdk16Q04735 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk16Q04735 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk16Q04735 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk16Q04735 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk16Q04735 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk16Q04735 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk16Q04735 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk16Q04735 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk16Q04735 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk16Q04735 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk16Q04735 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk16Q04735 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk16Q04735 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk16Q04735 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk16Q04735 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk16Q04735 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk16Q04735 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk16Q04735 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk16Q04735 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cdk16Q04735 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk16Q04735 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk16Q04735 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk16Q04735 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk16Q04735 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk16Q04735 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk16Q04735 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk16Q04735 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk16Q04735 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk16Q04735 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk16Q04735 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk16Q04735 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk16Q04735 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cdk16Q04735 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk16Q04735 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk16Q04735 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk16Q04735 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdk16Q04735 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk16Q04735 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk16Q04735 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk16Q04735 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk16Q04735 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk16Q04735 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdk16Q04735 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdk16Q04735 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdk16Q04735 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk16Q04735 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk16Q04735 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk16Q04735 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk16Q04735 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk16Q04735 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk16Q04735 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk16Q04735 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk16Q04735 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk16Q04735 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk16Q04735 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk16Q04735 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdk16Q04735 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk16Q04735 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk16Q04735 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk16Q04735 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk16Q04735 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk16Q04735 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk16Q04735 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk16Q04735 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk16Q04735 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk16Q04735 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk16Q04735 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk16Q04735 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk16Q04735 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk16Q04735 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk16Q04735 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk16Q04735 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms