Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kcnd1Q03719 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kcnd1Q03719 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Kcnd1Q03719 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Kcnd1Q03719 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kcnd1Q03719 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kcnd1Q03719 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Kcnd1Q03719 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Kcnd1Q03719 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Kcnd1Q03719 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Kcnd1Q03719 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kcnd1Q03719 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kcnd1Q03719 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kcnd1Q03719 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kcnd1Q03719 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kcnd1Q03719 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kcnd1Q03719 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kcnd1Q03719 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kcnd1Q03719 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kcnd1Q03719 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kcnd1Q03719 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kcnd1Q03719 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kcnd1Q03719 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Kcnd1Q03719 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Kcnd1Q03719 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kcnd1Q03719 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kcnd1Q03719 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kcnd1Q03719 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kcnd1Q03719 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kcnd1Q03719 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kcnd1Q03719 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kcnd1Q03719 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kcnd1Q03719 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kcnd1Q03719 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kcnd1Q03719 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kcnd1Q03719 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kcnd1Q03719 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kcnd1Q03719 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kcnd1Q03719 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Kcnd1Q03719 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kcnd1Q03719 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kcnd1Q03719 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kcnd1Q03719 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kcnd1Q03719 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kcnd1Q03719 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Kcnd1Q03719 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kcnd1Q03719 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kcnd1Q03719 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kcnd1Q03719 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kcnd1Q03719 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kcnd1Q03719 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kcnd1Q03719 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kcnd1Q03719 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kcnd1Q03719 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kcnd1Q03719 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Kcnd1Q03719 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kcnd1Q03719 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kcnd1Q03719 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kcnd1Q03719 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kcnd1Q03719 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kcnd1Q03719 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kcnd1Q03719 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Kcnd1Q03719 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kcnd1Q03719 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kcnd1Q03719 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kcnd1Q03719 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kcnd1Q03719 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kcnd1Q03719 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kcnd1Q03719 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kcnd1Q03719 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kcnd1Q03719 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kcnd1Q03719 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kcnd1Q03719 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kcnd1Q03719 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kcnd1Q03719 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Kcnd1Q03719 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kcnd1Q03719 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kcnd1Q03719 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kcnd1Q03719 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kcnd1Q03719 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kcnd1Q03719 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kcnd1Q03719 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kcnd1Q03719 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kcnd1Q03719 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kcnd1Q03719 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kcnd1Q03719 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kcnd1Q03719 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Kcnd1Q03719 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kcnd1Q03719 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kcnd1Q03719 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kcnd1Q03719 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kcnd1Q03719 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kcnd1Q03719 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kcnd1Q03719 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kcnd1Q03719 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kcnd1Q03719 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kcnd1Q03719 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Kcnd1Q03719 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Kcnd1Q03719 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kcnd1Q03719 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms