Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFHR1Q03591 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFHR1Q03591 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFHR1Q03591 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CFHR1Q03591 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFHR1Q03591 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFHR1Q03591 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFHR1Q03591 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFHR1Q03591 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFHR1Q03591 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFHR1Q03591 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFHR1Q03591 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFHR1Q03591 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFHR1Q03591 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFHR1Q03591 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFHR1Q03591 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFHR1Q03591 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFHR1Q03591 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFHR1Q03591 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFHR1Q03591 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFHR1Q03591 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFHR1Q03591 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFHR1Q03591 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFHR1Q03591 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFHR1Q03591 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CFHR1Q03591 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFHR1Q03591 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CFHR1Q03591 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFHR1Q03591 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFHR1Q03591 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFHR1Q03591 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFHR1Q03591 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFHR1Q03591 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFHR1Q03591 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFHR1Q03591 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFHR1Q03591 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFHR1Q03591 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CFHR1Q03591 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFHR1Q03591 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFHR1Q03591 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFHR1Q03591 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CFHR1Q03591 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFHR1Q03591 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFHR1Q03591 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFHR1Q03591 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFHR1Q03591 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFHR1Q03591 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFHR1Q03591 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFHR1Q03591 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CFHR1Q03591 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFHR1Q03591 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CFHR1Q03591 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CFHR1Q03591 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFHR1Q03591 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFHR1Q03591 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFHR1Q03591 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFHR1Q03591 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFHR1Q03591 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFHR1Q03591 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CFHR1Q03591 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFHR1Q03591 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFHR1Q03591 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFHR1Q03591 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFHR1Q03591 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFHR1Q03591 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFHR1Q03591 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFHR1Q03591 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CFHR1Q03591 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFHR1Q03591 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFHR1Q03591 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFHR1Q03591 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFHR1Q03591 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFHR1Q03591 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFHR1Q03591 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFHR1Q03591 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFHR1Q03591 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFHR1Q03591 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFHR1Q03591 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFHR1Q03591 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFHR1Q03591 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFHR1Q03591 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFHR1Q03591 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CFHR1Q03591 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFHR1Q03591 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFHR1Q03591 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFHR1Q03591 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFHR1Q03591 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFHR1Q03591 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFHR1Q03591 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFHR1Q03591 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFHR1Q03591 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFHR1Q03591 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFHR1Q03591 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFHR1Q03591 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFHR1Q03591 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFHR1Q03591 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFHR1Q03591 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFHR1Q03591 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFHR1Q03591 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFHR1Q03591 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms