Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ddr1Q03146 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ddr1Q03146 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Ddr1Q03146 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ddr1Q03146 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ddr1Q03146 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ddr1Q03146 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ddr1Q03146 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ddr1Q03146 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ddr1Q03146 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ddr1Q03146 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ddr1Q03146 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ddr1Q03146 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ddr1Q03146 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ddr1Q03146 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ddr1Q03146 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ddr1Q03146 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ddr1Q03146 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ddr1Q03146 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ddr1Q03146 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ddr1Q03146 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ddr1Q03146 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ddr1Q03146 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ddr1Q03146 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ddr1Q03146 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ddr1Q03146 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ddr1Q03146 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ddr1Q03146 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ddr1Q03146 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ddr1Q03146 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ddr1Q03146 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ddr1Q03146 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ddr1Q03146 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddr1Q03146 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ddr1Q03146 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ddr1Q03146 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ddr1Q03146 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ddr1Q03146 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ddr1Q03146 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ddr1Q03146 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ddr1Q03146 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ddr1Q03146 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ddr1Q03146 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ddr1Q03146 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ddr1Q03146 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ddr1Q03146 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ddr1Q03146 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ddr1Q03146 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ddr1Q03146 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ddr1Q03146 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ddr1Q03146 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ddr1Q03146 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ddr1Q03146 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ddr1Q03146 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ddr1Q03146 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ddr1Q03146 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ddr1Q03146 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ddr1Q03146 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ddr1Q03146 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ddr1Q03146 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ddr1Q03146 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ddr1Q03146 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ddr1Q03146 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ddr1Q03146 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ddr1Q03146 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ddr1Q03146 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ddr1Q03146 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ddr1Q03146 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ddr1Q03146 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ddr1Q03146 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ddr1Q03146 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ddr1Q03146 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ddr1Q03146 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ddr1Q03146 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ddr1Q03146 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ddr1Q03146 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ddr1Q03146 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ddr1Q03146 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ddr1Q03146 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ddr1Q03146 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ddr1Q03146 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ddr1Q03146 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ddr1Q03146 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ddr1Q03146 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ddr1Q03146 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ddr1Q03146 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ddr1Q03146 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ddr1Q03146 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ddr1Q03146 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ddr1Q03146 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ddr1Q03146 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ddr1Q03146 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ddr1Q03146 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ddr1Q03146 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ddr1Q03146 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ddr1Q03146 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ddr1Q03146 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ddr1Q03146 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ddr1Q03146 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ddr1Q03146 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms