Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CACNB1Q02641 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CACNB1Q02641 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CACNB1Q02641 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CACNB1Q02641 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CACNB1Q02641 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CACNB1Q02641 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CACNB1Q02641 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CACNB1Q02641 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CACNB1Q02641 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CACNB1Q02641 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CACNB1Q02641 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CACNB1Q02641 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CACNB1Q02641 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CACNB1Q02641 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CACNB1Q02641 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CACNB1Q02641 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CACNB1Q02641 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CACNB1Q02641 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CACNB1Q02641 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CACNB1Q02641 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CACNB1Q02641 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CACNB1Q02641 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CACNB1Q02641 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CACNB1Q02641 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CACNB1Q02641 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CACNB1Q02641 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CACNB1Q02641 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CACNB1Q02641 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CACNB1Q02641 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CACNB1Q02641 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CACNB1Q02641 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CACNB1Q02641 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CACNB1Q02641 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CACNB1Q02641 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CACNB1Q02641 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CACNB1Q02641 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CACNB1Q02641 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CACNB1Q02641 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CACNB1Q02641 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CACNB1Q02641 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CACNB1Q02641 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CACNB1Q02641 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CACNB1Q02641 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CACNB1Q02641 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CACNB1Q02641 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CACNB1Q02641 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CACNB1Q02641 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CACNB1Q02641 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CACNB1Q02641 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CACNB1Q02641 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CACNB1Q02641 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CACNB1Q02641 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CACNB1Q02641 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CACNB1Q02641 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CACNB1Q02641 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CACNB1Q02641 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CACNB1Q02641 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CACNB1Q02641 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CACNB1Q02641 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CACNB1Q02641 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CACNB1Q02641 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CACNB1Q02641 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CACNB1Q02641 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CACNB1Q02641 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CACNB1Q02641 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CACNB1Q02641 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CACNB1Q02641 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CACNB1Q02641 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CACNB1Q02641 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CACNB1Q02641 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CACNB1Q02641 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CACNB1Q02641 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CACNB1Q02641 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CACNB1Q02641 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CACNB1Q02641 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CACNB1Q02641 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CACNB1Q02641 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CACNB1Q02641 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CACNB1Q02641 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CACNB1Q02641 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CACNB1Q02641 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CACNB1Q02641 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CACNB1Q02641 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CACNB1Q02641 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CACNB1Q02641 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CACNB1Q02641 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CACNB1Q02641 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CACNB1Q02641 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CACNB1Q02641 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CACNB1Q02641 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CACNB1Q02641 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CACNB1Q02641 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CACNB1Q02641 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CACNB1Q02641 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CACNB1Q02641 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CACNB1Q02641 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CACNB1Q02641 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CACNB1Q02641 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CACNB1Q02641 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms