Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
APBA1Q02410 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
APBA1Q02410 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
APBA1Q02410 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
APBA1Q02410 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
APBA1Q02410 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
APBA1Q02410 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
APBA1Q02410 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
APBA1Q02410 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
APBA1Q02410 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
APBA1Q02410 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
APBA1Q02410 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
APBA1Q02410 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
APBA1Q02410 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
APBA1Q02410 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
APBA1Q02410 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
APBA1Q02410 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
APBA1Q02410 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
APBA1Q02410 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
APBA1Q02410 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
APBA1Q02410 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
APBA1Q02410 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
APBA1Q02410 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
APBA1Q02410 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
APBA1Q02410 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
APBA1Q02410 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
APBA1Q02410 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
APBA1Q02410 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
APBA1Q02410 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
APBA1Q02410 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
APBA1Q02410 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
APBA1Q02410 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
APBA1Q02410 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
APBA1Q02410 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
APBA1Q02410 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
APBA1Q02410 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
APBA1Q02410 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
APBA1Q02410 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
APBA1Q02410 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
APBA1Q02410 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
APBA1Q02410 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
APBA1Q02410 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
APBA1Q02410 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
APBA1Q02410 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
APBA1Q02410 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
APBA1Q02410 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
APBA1Q02410 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
APBA1Q02410 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
APBA1Q02410 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
APBA1Q02410 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
APBA1Q02410 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
APBA1Q02410 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
APBA1Q02410 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
APBA1Q02410 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
APBA1Q02410 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
APBA1Q02410 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
APBA1Q02410 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
APBA1Q02410 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
APBA1Q02410 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
APBA1Q02410 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
APBA1Q02410 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
APBA1Q02410 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
APBA1Q02410 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
APBA1Q02410 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
APBA1Q02410 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
APBA1Q02410 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
APBA1Q02410 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
APBA1Q02410 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
APBA1Q02410 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
APBA1Q02410 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
APBA1Q02410 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
APBA1Q02410 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
APBA1Q02410 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
APBA1Q02410 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
APBA1Q02410 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
APBA1Q02410 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
APBA1Q02410 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
APBA1Q02410 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
APBA1Q02410 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
APBA1Q02410 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
APBA1Q02410 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
APBA1Q02410 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
APBA1Q02410 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
APBA1Q02410 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
APBA1Q02410 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
APBA1Q02410 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
APBA1Q02410 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
APBA1Q02410 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
APBA1Q02410 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
APBA1Q02410 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
APBA1Q02410 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
APBA1Q02410 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
APBA1Q02410 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
APBA1Q02410 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
APBA1Q02410 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
APBA1Q02410 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
APBA1Q02410 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
APBA1Q02410 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
APBA1Q02410 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
APBA1Q02410 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms